Perekonna Dianthus L. sektsiooni Plumaria liikide geneetiline varieeruvus ja fülogeneetilised suhted mikrosatelliitmarkerite alusel
Date
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Perekond nelk on liigirikas rühm, mille paljud liigid on piiratud levilaga. On näidatud, et suur
osa neist on lahknenud evolutsiooniliselt hiljuti ja lühikese aja jooksul, mistõttu oleks nelkide
näitel võimalik uurida radiatsiooni, üht evolutsiooni olulist protsessi. Häid meetodeid nende
fülogeneesi uurimiseks jaoks pole veel leitud, seega uurib töö, kas nelkide sektsiooni Plumaria
sisest geneetilist variatsiooni ja fülogeneetilisi suhteid on võimalik uurida genoomides levinud
lühikeste korduvjärjestuste e. mikrosatelliitide abil. 11 nelgi liigis tuvastati 146 alleeli 10-st
tuuma lookusest ning leiti, et suur osa varieeruvusest on liikide sees. Peakoordinaatanalüüs ja
dendrogrammid näitasid, et liigid ei eristunud üksteisest, v.a D. superbus ja D. plumarius.
Seega, antud mikrosatelliitmarkerite abil on nende fülogeneesi raske uurida. Põhjuseid võib olla
mitmeid – sektsiooni kunstlik püstitus, kehv geneetiline eristuvus ning perekonna jaoks välja
töötatud markerite ebasobivus liikidevahelise fülogeneesi uuringuks
Description
Keywords
geneetiline varieeruvus, Nelk, fülogeneetilised suhted, molekulaarsed markerid