Statistilised mudelid bakterite segude määramiseks

Simple item page
dc.contributor.advisorMöls, Märt, juhendaja
dc.contributor.authorLaaneväli, Anna
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Matemaatika ja statistika instituutet
dc.date.accessioned2020-02-14T08:34:48Z
dc.date.available2020-02-14T08:34:48Z
dc.date.issued2020
dc.description.abstractProovis sisalduva bakterite DNA sekveneerimisel on võimalik öelda, milliste bakterite DNAd proovis nähti ning mis koguses. Sekveneerimisel saadud andmeid on võimalik analüüsida vähimruutude, mittenegatiivsete vähimruutude või suurima tõepära meetodit kasutades, tuvastamaks bakterite tüvesid ning hindamaks nende k-meeride katvust. Magistritöö eesmärgiks on võrrelda kolme nimetatud meetodi käitumist sekveneerimisvigade olemasolu korral, vastavalt vigadega arvestades kui arvestamata. Vaatlusaluseid meetodeid rakendatakse ka ühe reaalse proovi sekveneerimisel kogutud andmete (saadud Tartu Ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudist) analüüsil.et
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10062/67117
dc.language.isoestet
dc.rightsopenAccesset
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectmittenegatiivne vähimruutude meetodet
dc.subjectsuurima tõepära meetodet
dc.subjectk-meeridet
dc.subjectsekveneerimineet
dc.subjectR (programmeerimiskeel)et
dc.subjectnon-negative least squares methoden
dc.subjectsequencingen
dc.subjectR (programming language)en
dc.subjectmaximum likelihood methoden
dc.subjectk-mersen
dc.subject.otherhindamineet
dc.subject.othervähimruutude meetodet
dc.subject.otherDNAet
dc.subject.otherestimationen
dc.subject.otherleast squares methoden
dc.titleStatistilised mudelid bakterite segude määramisekset
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesiset

Files

Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
laanevali_anna_msc_2020.pdf
Size:
996.55 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Download
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.67 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description:
Download

Collections

LTMS magistritööd -- Master's theses