K-meeridel põhinev antibiootikumiresistentsuse markerite tuvastamine bakteris Pseudomonas aeruginosa
Date
2017
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Antibiootikumide kasutamist on piiranud nende kasutusele võtmisele järgnenud kiire
resistentsuse ilmumine bakterite seas. Resistentsete bakterite vastu võitlemisel on oluline
identifitseerida bakterites uusi resistentsust põhjustavaid geene ja mutatsioone. Need
teadmised võimaldavad näiteks disainida uusi kiireid DNA põhiseid teste resistentsete
fenotüüpide tuvastamiseks ja optimiseerida antibiootikumikuure.
Käesoleva magistritöö kirjanduse ülevaates tutvustatakse resistentsust, selle levikut,
mehhanisme ja muid aspekte. Praktilises osas loodi k-meeridel põhinev töövoog, mille abil
tuvastati P. aeruginosa genoomist nii varem teadaolevaid kui potentsiaalseid uusi
resistentsusega seotud markereid.
Description
Keywords
antibiootikumiresistentsus, genoomsed markerid, k-meerid, Pseudomonas aeruginosa