Päritolu hindamine geeniandmete põhjal: TÜ Eesti Geenivaramu andmete analüüs

dc.contributor.advisorFischer, Krista, juhendaja
dc.contributor.authorOjavee, Sven Erik
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Matemaatika ja statistika instituutet
dc.date.accessioned2018-02-21T09:49:08Z
dc.date.available2018-02-21T09:49:08Z
dc.date.issued2018
dc.description.abstractKäesoleva magistritöö eesmärk on leida võimalusi andmaks geenidoonoritele tagasisidet nende päritolu kohta, lähtudes SNPde andmetest. Nendele tuginedes on leitud peakomponendid, millele rajaneb edasine analüüs. Esmalt kirjeldatakse päritolu rahvuste tasandil, mille käigus antakse doonorile tõenäosuslik hinnang kuulumise kohta 22 rahvusgrupi hulka. Sellele järgnevalt kirjeldatakse päritolu Eesti-siseselt, kus leitakse K-keskmiste klasterdamise algoritmi abil Eesti sees tekkivad klastrid, mis moodustavad geograafiliselt loogilisi tervikuid. Klasterdamise tulemusi rakendatakse selleks, et klassifitseerida tekkinud klastrite alusel ning pakkuda ka hinnang klastritesse kuulumise tõenäosustele. Ühtlasi kontrollitakse, kui hästi töötab Eesti-sisene klassifitseerimine, valides klassideks maakonnad. Klassifitseerimismeetoditest võrreldakse lineaarset diskriminantanalüüsi, tugivektormasinaid ning juhuslikke metsi.et
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10062/59324
dc.language.isoestet
dc.subjectsimulatsioonet
dc.subjectkõrgdimensionaalsed andmedet
dc.subjectklasteranalüüset
dc.subjectklassifitseerimineet
dc.subjecttehisõpeet
dc.subjectmitmemõõtmeline skaleerimineet
dc.subjectsimulationen
dc.subjecthigh-dimensional dataen
dc.subjectautomatic learningen
dc.subjectmultidimensional scalingen
dc.subjectcluster analysisen
dc.subjectclassificationen
dc.titlePäritolu hindamine geeniandmete põhjal: TÜ Eesti Geenivaramu andmete analüüset
dc.typeThesiset

Files

Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
ojavee_sven_erik_msc_2018.pdf
Size:
8.3 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: