Eespool kirjeldatud meetodite kõrval on histoloogias kasutusel ka mitmeid teisi uurimismeetodid, näiteks:
 
- Koekultuuride meetod
     
Rakkude struktuuri ja funktsiooni tundma õppimiseks on rakke võimalik kasvatada väljaspool organismi (in vitro) katseklaasis: suspensioonid, kilekultuurid jms. Koekultuure võib kasvatada ka organismis endas (in vivo) isoleeritud kambrites.
 
- Rakkude fraktsioneerimine
 
Rakkude fraktsioneerimine e.osadeks jaotamine saavutatakse tsentrifuugimise teel. Meetod võimaldab lähemalt uurida raku koostisosade - rakutuuma, mitokondrite, endoplasmaatilise retiikulumi jt. ehitust ja funktsiooni.
- Autoradiograafia
 
Autoradiograafia puhul viiakse kudedesse radioaktiivselt märgistatud metaboliidid. Metaboliitidega reageerinud rakud tehakse kindlaks fotograafiliste emulsioonide abil. Meetod võimaldab uurida rakkude funktsioone, nt. radioaktiivse tümidiiniga saab määrata aktiivses jagunemises olevaid rakke.