S. pombe tsentromeersed järjestused

Schizosaccharomyces pombe tsentromeersed alad on erinevates kromosoomides erineva pikkusega:
  • kromosoomi I tsentromeer - 35 kb
  • kromosoomi II tsentromeer - 65 kb
  • kromosoomi III tsentromeer - 110 kb
Kõik tsentromeersed alad kokku on pikkusega 0.2 Mb.
 
Tsentromeer koosneb kahest domeenist: tsentraalne põhidomeen ja välimised kordusjärjestused (joonis 2). Tsentraalne põhidomeen sisaldab keskmist põhiregiooni (cnt), mis ei sisalda kordusjärjestusi. Tsentraalsele põhidomeenile seonduvad tsentromeeri spetsiifiline histoon H3 variant Cenp-A (S. pombe puhul nimetatakse seda Cnp1), mis on oluline kinetohoori moodustumisel. Keskmine põhiregioon on ümbritsetud pööratud sisemiste kordusjärjestustega imrL ja imrR. Sisemised kordusjärjestused on igal kromosoomil erinevad. Tsentromeeri välimine domeen (otr) koosneb samuti kordusjärjestustest, mida nimetatakse dg ja dh. Need kordusjärjestused on kõikides kromosoomides konserveerunud. Välimised kordusjärjestused on pakitud heterokromatiinina. Sellele regioonile on iseloomulik histoonide epigeneetilised modifikatsioonid: histooni H3 üheksandas positsioonis oleva lüsiini (K9) metülatsioon ning histoonide H3 ja H4 deatsetüleerimine. Histoonide H3 ja H4 N-terminaalsete sabade deatsetüleerimise viivad läbi deatsetülaasid Clr3, Clr6 ja Sir2. H3 metüleeritakse metüültransferaas Clr4 poolt. Metüleeritud H3-ga seonduvad kromodomeeni valgud Swi6 ja Chp1. Swi6 seondumine lukustab kromatiini transkriptsiooniliselt mitteaktiivsesse olekusse.
 
Joonis 2. Skemaatiline S. pombe tsentromeeri struktuur.