Erinevate transformatsioonimeetodite võrdlus
Erinevatel pärmirakku transformeerivatel meetoditel on rida eeliseid ja samas ka puududsi. Need on ülevaatlikult toodud tabelis 1.
Tabel 1. Erinevate transformatsioonimeetodite võrdlus.
Meetod
|
Eelised
|
Puudused
|
Sferoplastide transformatsioon
|
- võimalik efektiivselt transformeerida suuri DNA konstrukte (näteiks pärmi kunstlikud kromosoomid)
- ei vaja spetsiaalset aparatuuri
- odav
|
- keeruline optimiseerida
- alustatakse pärmi üleöö kasvanud kultuurist
- ajamahukas
- rakud tuleb külvata osmootselt stabiliseerivale söötmele
- erinevatel tüvedel on väga erinev transformatsiooni efektiivsus
|
|
LiAc / kandur DNA / PEG
|
- kõige efektiivsem meetod (va. suured DNA konstruktid)
- ei vaja spetsiaalset aparatuuri
- lihtne protokoll
- kergesti optimiseeritav
- võimalik kasutada külmutatud kompetentseid rakke
- odav
|
- alustatakse pärmi üleöö kasvanud kultuurist (va. kui kasutatakse külmutatud kompetentseid rakke)
- erinevatel tüvedel võib olla erinev transformatsiooni efektiivsus
|
Elektroporatsioon
|
- efektiivne meetod (va. suured DNA konstruktid)
- lühike protokoll
- kergesti optimiseeritav
- võimalik kasutada külmutatud kompetentseid rakke
|
- vajalik spetsiaalne aparatuur
- alustatakse pärmi üleöö kasvanud kultuurist (va. kui kasutatakse külmutatud kompetentseid rakke)
- erinevatel tüvedel võib olla erinev transformatsiooni efektiivsus
|
Biolistiline meetod
|
- suhteliselt efektiive meetod
- võimalik transformeerida mitokondrit
|
- vajalik spetsiaalne aparatuur
- keeruline on ette määrata transformatsiooni efektiivsust
- vajalik ette valmistada DNA-ga kaetud osakesed
|