Kuidas uurida tsentromeeriga aheldatust?
Me soovime kindlaks teha geeni A kaugust kromosoomi tsentromeerist. Selleks tuleb läbi viia tetraadide analüüs kasutades tüve, kus geen A ja tsentromeeriga seotud marker on heterosügootsete alleelidena. Pagaripärmi kromosoomis IV on tsentromeeriga aheldatud markergeeniks TRP1. Kuna TRP1 paikneb tsentromeerile väga lähedal, siis geeni ja tsentromeeri vahel ristsiiret ei toimu.
Kui geen A on kaugel tsentromeerist, siis tekivad 4 erinevat tetratüüpi tetraadi (Joonis 22). Iga tetratüübi tekkimise tõenäosus on sama mis vanemtüüpi ja mittevanemtüüpi tetraadide korral. Seega PD:NPD:T = 1:1:4.
Kui geen A paikneb tsentromeeri lähedal, siis ristsiirde toimumine väheneb ning seetõttu tekib ka vähem tetratüüpi tetraade, e. PD:NPD:T = 1:1:>4. Seega, mida lähemal on geen A tsentromeerile, seda vähem tekib tetratüüpi tetraade.
Joonis 22. Kui geeni A ja tsentromeeri vahel toimub ristsiire, siis vanemtüüpi ja
mittevanemtüüpi tetraade asemel tekivad tetratüüpi tetraadid.
mittevanemtüüpi tetraade asemel tekivad tetratüüpi tetraadid.
Geeni A kaugust tsentromeerist saab arvutada valemi abil:
Selline geeni A kauguse määramine tsentromeerist eeldab, et
- tetratüüpi tetraadid tekivad vaid geeni ja tsentromeeri vahel toimuva ühe ristsiirde tagajärjel
- vanemtüüpi ja mittevanetüüpi tetraadide tekkimisel ei toimu ristsiiret
Seega ei võeta arvesse ristsiirdeid, mis toimuvad kahe, kolme ja nelja DNA ahela vahel.