Noble & Johnson geenideletsiooni meetod

S.M. Noble ja A.D. Johnsoni poolt 2005.a. välja töötatud geenideletsiooni meetod kasutab rakkude transformeerimisel DNA fragmente, mis sisaldavad pikki (~350-500 nukleotiidi pikkuseid) geenist ülesvoolu ja allavoolu jäävaid homoloogilisi järjestusi. Need DNA fragmendid paljundatakse kasutades liit-PCR ("fusion PCR") meetodit (joonis 9). Esimeses etapis paljundatakse lookuse spetsiifilised järjestused ja selektsioonimarker. Viiakse läbi kolm eraldi reaktsiooni:
  1. paljundatakse geenist ülesvoolu jääv järjestus;
  2. paljundatakse geenist allavoolu jääv järjestus;
  3. paljundatakse selektsioonimarker.
Teises etapis liidetakse saadud DNA fragmendid ning lõpptulemusna saadakse üks DNA molekul.
 
Joonis 9. Liit-PCR meetodi põhimõte.
 
Homosügootne geenideletsioon konstrueeritakse kahe järjestikuse transformatsiooni abil (joonis 10):
  1. Geeni esimene alleel deleteeritakse C. dubliniensis HIS1 markergeeni kasutades. Transformandid selekteeritakse söötmel, millest puudub histidiin.
  2. Geeni teine alleel deleteeritakse C. maltosa LEU2 markergeeni kasutades. Transformandid selekteeritakse söötmel, millest puuduvad histidiin ja leutsiin.

Joonis 10. Noble & Johnson geenideletsiooni meetod.