Browsing by Author "Smertina, Anna"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 1 of 1
  • Thumbnail Image
    listelement.badge.dso-type Item , listelement.badge.access-status Open Access ,
    Inimgenoomi ühenukleotiidiliste variatsioonide annotatsioon – ülevaade põhimõtetest ning teise põlvkonna sekveneerimise võimalike artefaktsete SNVde annoteerimine
    (Tartu Ülikool, 2016) Smertina, Anna; Talas, Ulvi Gerst; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Teise põlvkonna sekveneerimine võimaldab tänu oma kiirusele ja suhtelisele odavusele järjestada kiiresti palju genoome, mille baasil on võimalik läbi viia nii ülegenoomseid assotsiatsiooniuuringuid kui ka kasutada andmeid kliinilises praktikas. Mõlemad lähenemised sõltuvad tugevalt SNVde ja teiste variatsioonide õigest tuvastamisest ning täpsest annotatsioonist. Antud töös tutvustatakse SNVde annoteerimise protsessi ja selle eripärasid, tuuakse välja annotatsiooni tõlgendamise erinevused lähtuvalt erinevatest tööriistadest ning andmebaasidest. Töö praktilises pooles näidatakse, et valepositiivselt tuvastatud SNVd võivad annoteerimise ja tulemuste tõlgendamise põhjal olla näiliselt füsioloogiliselt olulised. Artefaktsete SNVde tuvastamisega arvestamine võimaldab vältida vigaste andmete põhjal tehtud ekslikke järeldusi.