Sõltuvate jadade mudel
Date
2013-06-12
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Kui evolutsiooni käigus tekib ühest liigist kaks uut, on uute liikide genoomid omavahel sarnased. Selline uute liikide tekkimine tähendab, et eellasliigi DNA-jadaga on toimunud teisendusi, täpsemalt: 1) mõned jada elemendid on asendunud teistega (mutatsioonid), 2) jada varasemate elementide vahele on sisestatud uusi elemente (sisestused), 3) jadast on elemente kaduma läinud (kadumised).
Seega, mida lähemal on liigid evolutsioonipuus üksteisele, seda sarnasemad on nende genoomid.
Töö on jagatud kaheks peatükiks. Esimene peatükk on puhtteoreetiline. Siin konstrueeritakse mudel jada kahe järglasjada
moodustumiseks koos mutatsioonide ja kadumistega. Lisaks esitatakse mõned teoreetilised tulemused mudeli kohta.
Teine peatükk keskendub simulatsioonidele. Siin tutvustatakse üht lihtsamat pikima ühisjada pikkusel põhinevat jadade sarnasusmõõtu ning uuritakse, kuidas esimeses peatükis konstrueeritud järglasjadade sarnasus sõltub nende vahelisest sõltuvusmäärast.
Töös esitatud tõestuskäigud on autor kas ise leidnud või leidnud etteantud skeemi või idee põhjal.