Põhjuslikud mudelid Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu metaboloomika ja toitumise andmetel

Date

2015

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Tartu Ülikool

Abstract

Käesolevas magistritöös uuritakse põhjuslikke seoseid kohvi tarbimise, metaboliitide kontsentratsiooni taseme ja vererõhu vahel, kasutades Mendeli randomiseerimise meetodit. Riskitegurite põhjusliku mõju hindamisel huvipakkuvale haigusele või tervisenäitajale, on nimetatud meetodi korral instrumenttunnusena kasutusel geneetilised markerid, mille mõju eksponenttunnusele on teada. Töös on otsitavatele parameetritele hinnangud leitud nii Mendeli randomiseerimist kui ka lineaarset regressioonanalüüsi kasutades. Ilmnes, et lineaarne regressioonanalüüs annab küll statistiliselt olulised seosed, ent Mendeli randomiseerimisel saadud tulemuste põhjal ei ole võimalik kinnitada seose põhjuslikkust. Lisaks pakutakse töös välja Mendeli randomiseerimise meetodi edasiarendus juhule, kus põhjuslik seoseahel on keerukam. Simulatsioonieksperiment kinnitab, et meetodi edasiarendus annab eelduste kehtimise korral soovitud tulemused. Reaalsete andmete korral osutusid instrumenttunnused aga liiga nõrgaks, et soovitud täpsusega tulemusi saada.

Description

Keywords

randomiseerimine, regressioonanalüüs, geneetiline muutlikkus, põhjuslikkus, geenid, ühenukleotiidsed polümorfismid

Citation