Telomeeride pikkuste seosed DNA metülatsiooniga
Date
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Viimastel aastatel on olnud palju uuringuid kromosoomide telomeerse DNA pikkuse seosega erinevates rakufunktsioonides alates raku vananemisprotesssi käivitamisest kuni kasvajate tekke indutseerimiseni.
Käesolevas töös uuriti metülatsioonitaseme ja telomeeride pikkuste vahelisi seoseid. Valim koosnes 747 indiviidist, kus kõige noorem oli 18-aastane ja kõige vanem 84-aastane. Selleks mõõdeti telomeeride suhteline keskmine pikkus Q-PCR meetodil ning mudeldati telomeeride pikkuse mõju DNA metülatsioonile.
Meta-analüüsi tulemustes epigenoomselt olulisi CpG saite välja ei tulnud. Siiski parimad viis leidu näitasid võimalikku seost DNA metülatsiooni taseme ja telomeeride pikkuse vahel. Nende hulgas näiteks MAP3K11 geen, mille puhul on varem näidatud, et see on oluline rakujagunemise regulatsioonil. Samuti tulid meta-analüüsi tulemustes välja potentsiaalselt huvitavad geenid MPP4, CABP7 ja MRPS6/SLC5A3, mida tuleks kinnitada teises kohordis.
Description
Keywords
Telomeerid, DNA metülatsioon, telomeeride mõõtmismeetodid, EWAS, vananemine