YbeY valgu toimemehhanismist rRNA ja ribosoomide metabolismis Escherichia coli’s

Date

2016

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Tartu Ülikool

Abstract

YbeY on Escherichia coli endoribonukleaas ja kuumašoki valk. Selle osalust on näidatud 16S rRNA protsessimisel, ribosoomide kvaliteedikontrollis ja ribosoomide lagundamisel. On püstitatud hüpotees, et YbeY endoribonukleaasne aktiivsus pole kõigis nendes protsessides osalemiseks vajalik. Oma töös olen uurinud kahe ensümaatiliselt inaktiivse YbeY mutandi fenotüüpe erinevates tingimustes. Üks neist, YbeY-R59A, kutsub esile fenotüübi, mis vastab metsiktüüpi YbeY valgu fenotüübile. Näib, et vähemalt teatud protsessides ei pea YbeY oma funktsiooni täitmiseks endoribonukleaasset aktiivsust omama. Samas aga meenutab YbeY-H114A mutanti sisaldava tüve fenotüüp ΔybeY tüve oma. Need tulemused viitavad võimalusele, et YbeY võib erinevates ribosoomide biogeneesi ja lagundamisega seotud protsessides erinevalt funktsioneerida. Olen selles töös esitanud mudeli, mis võib seletada aminohappejääkide R59 ja H114 rolli YbeY valgus. YbeY täpse toimemehhanismi välja selgitamiseks rRNA ja ribosoomide metabolismis on vaja veel tööd teha.

Description

Keywords

YbeY, rRNA protsessimine, ribosoomide lagundamine, ribosoomid, CPEC

Citation