Redundant salicylate 1-hydroxylase genes of the Pseudomonas pseudoalcaligenes C70
Date
2019
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
In English: Naphthalene, salicylate and phenol-degrading Pseudomonas pseudoalcaligenes C70
has two redundant salicylate 1-hydroxylases genes, n ahG and n ahW. The comparison of the
deduced amino acid sequence of n ahW and n ahG of C70 showed that they are almost
identical (identity 99.8-100%) with those of the P. stutzeri strain AN10. NahWs of the C70
and AN10 formed separate group on phylogenetic tree and they were phylogenetically
different from classical NahG sequences. In the mid-logarithmic growth phase the n ahW
expression level was higher than n ahG, but both n ahW and n ahG were expressed at the
similar level in the early stationary growth phase. The lag-phase length of C70 did not change
significantly on used salicylate concentrations (1-3 mM). Strain C70 was able to tolerate
salicylate concentrations up to 25 mM, although concentrations higher than 17 mM were
stressful for cells. There is a strong possibility that the degradation of the salicylate is
enhanced due to the presence of two salicylate hydroxylases.
Eesti keeles: Naftaleeni, salitsülaati ja fenooli lagundav Pseudomonas pseudoalcaligenes tüvi C70
omab kahte redundantset salitsülaadi 1-hüdroksülaasi geeni, n ahG ja n ahW . Tüve C70 n ahW
ja n ahG ennustatud aminohappeliste järjestuste võrdlus näitas, et need on väga sarnased P.
stutzeri tüve AN10 vastavate järjestustega (identsusprotsent 99,8-100%). Tüvede C70 ja
AN10 NahW järjestused moodustasid fülogeneetilisel puul eraldi rühma ja need olid
fülogeneetiliselt erinevad klassikalistest NahG järjestustes. Logaritmilises kasvufaasis oli
nahW ekspressioonitase kõrgem kui n ahG , samas kui nii n ahW kui n ahG on ekspresseeritud
sarnasel tasemel varajases statsionaarses kasvufaasis. Tüve C70 lag-faasi pikkus ei muutunud oluliselt kasutatud salitsülaadi kontsentratsioonidel (1-3 mM). Tüvi C70 oli võimeline taluma
kuni 25 mM salitsülaadi kontsentratsiooni kasvukeskkonnas, kuigi kontsentratsioonidel üle 17
mM oli rakkude kasv häiritud ning söötmesse tekkisid rakkude kogumikud. Tõenäoliselt aitab
tüvel C70 kõrgeid salitsülaadi kontsentratsioone taluda kahe salitsülaadi 1-hüdroksülaasi
olemasolu.
Description
Keywords
Pseudomonas, biodegradation, salicylate, salicylate 1-hydroxylase, redundant gene, biodegradatsioon, salitsülaat, salitsülaadi 1-hüdroksülaas, redundantne geen