Herodes, Koit, juhendajaMaciel, Larissa SilvaTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond2024-07-152024-07-152024-07-15978-9916-27-586-3978-9916-27-587-0 (pdf)1406-02992806-2159 (pdf)https://hdl.handle.net/10062/102010Väitekirja elektrooniline versioon ei sisalda publikatsiooneAminoühendid, eriti aminohapped, omavad suurt bioloogilist tähtsust, nagu ka nende tuvastamine kliinilises diagnostikas ning näiteks taimede metaboolsete radade ja biomarkerite uurimisel. Nendes valdkondades kasutatakse sageli kõrglahutusega massispektromeetriat (HRMS). Keerulise koostisega proovides tuvastatakse aga liiga palju ühendeid. Selles töös võetakse kasutusele derivatiseerimisele suunatud analüüsi lähenemisviis, mis ühendab derivatiseerimise ja ühiste fragmentide massispektromeetrilise tuvastamise derivatiseeritud analüütides. Nii on võimalik piirata detekteeritavate ühendite hulka konkreetse funktsionaalrühma alusel. See lähenemine kasutab MS detekteerimiseks eellasioonide skaneerimise (PIS) režiimi, kui fragmenteerumisel tekib ühine laetud fragment, ja neutraali kao (NLS) režiimi, kui tekib ühine neutraalne fragment. Meetod optimeeriti aminoühendite tuvastamiseks, kasutades derivatiseerimist dietüületoksümetüleenmalonaadiga (DEEMM) ja NLS-režiimi kolmekordse kvadrupooliga (QqQ) instrumendis, pakkudes kõrget selektiivsust aminoühendite suhtes madalatel kontsentratsioonidel . Meetodit rakendati Vahemere piirkonnast pärit 5 taimeliigi 42 proovi puhul, mis näitas, et aminoühendite sisalduse alusel on võimalik eristada taimeperekondi. Meetodit kasutati ka vabade aminoühendite sisalduse määramiseks põllumajanduslike kõrvalsaaduste kui võimalike söödalisandite analüüsimiseks.Meetodi abil tuvastati taimeekstraktides edukalt 50 aminoühendit ning enamik neist ka kvantifitseeriti.Amino compounds, especially amino acids, are of great biological importance and so is their detection in the field of clinical diagnosis and for the study of plant metabolic pathways and biomarkers, for instance. In these fields, high-resolution mass spectrometry (HRMS) is often employed. However, an excessive number of compounds are detected in complex samples. In this work, the derivatization-targeted analysis approach is introduced, which combines derivatization and the mass spectrometric detection of common fragments due to the derivatization moiety of the derivatized analytes. In that way, a specific functional group is targeted, so it is possible to narrow down the number of possible compounds detected in a sample. This is achieved by employing precursor ion scan (PIS) mode for recurrent charged fragments or neutral loss scan (NLS) mode for common neutral losses. This approach was optimized for the detection of amino compounds, based on diethyl ethoxymethylenemalonate (DEEMM) derivatization and NLS mode in a triple quadrupole (QqQ) instrument, providing increased selectivity towards amino compounds at low concentrations. The method was applied to 42 samples of 5 plant species from the Mediterranean region, revealing that the amino compound content allows the distinction between plant genera. In addition, it was used to analyze agricultural by-products as potential feed supplements based on their free amino compounds profile. The method successfully detected and identified 50 amino compounds in plant extracts, and most of them were quantified as well.enAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 EstoniaThesis