Sein, HelenKristjuhan, ArnoldVärv, SigneVäärtnõu, MerilinTartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskondTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut2016-06-292016-06-292016http://hdl.handle.net/10062/52103Eukarüootides toimuvat transkriptsiooni ning RNA polümeraas II (RNAPII) ja nukleosoomide hulga dünaamikat transkriptsioonil on kirjeldatud maailma mastaabis juba palju: on teada, et transkribeeritaval geenil eemaldatakse nukleosoomid ning geeni piirkond täitub RNA polümeraasidega. RNAPII ja nukleosoomide hulga uurimiseks märgitakse valgud erinevate epitoopidega. Selle töö raames uuriti immuunosadestamise meetodil, kuidas mõjutab erinevate epitoopidega märkimine RNAPII ja nukleosoomide hulka ning millist epitoopi valkude märkimiseks eelistada. Selleks märgiti subühik Rpb3 RNAPII hulga iseloomustamiseks ning histoon H3 nukleosoomide hulga iseloomustamiseks epitoopidega. Omavahel võrreldi kromatiini laboris kasutatavaid E2 ja E4 epitoope ning leiti, et nii nukleosoomide kui ka RNAPII hulga määramiseks sobib kõige paremini E2 epitoop. Samuti kasvab RNAPII detekteerimise tugevus epitoopide korduste kasvades. Histoon H3 puhul sellist korrelatsiooni ei täheldatud.ethistoonRNA polümeraasepitooptranskriptsioonnukleosoombakalaureusetöödThesis