Fischer, Krista, juhendajaOrg, Elin, juhendajaAasmets, OliverTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondTartu Ülikool. Matemaatika ja statistika instituut2018-06-272018-06-272018http://hdl.handle.net/10062/61022Inimese soolestikus on suur hulk erinevaid baktereid, mis täidavad organismi jaoks mitmeid olulisi funktsioone. Käesoleva magistritöö eesmärk on uurida, kas teist tüüpi diabeedi eelses seisundis indiviidide soolestiku bakterikoosluses on muudatusi võrreldes tervete indiviidide bakterikooslusega. Võrreldakse bakterikoosluse puhul huvitavaid α- ning β - mitmekesisuse näitajaid. Seejärel uuritakse Mendeli randomiseerimise skeemi abil, missugune võiks olla bakterikoosluse liigirikkuse põhjuslik mõju prediabeedile.Lisaks uuritakse, kas leidub üksikuid baktereid, mis esinevad tervete ja prediabeetikute mikrobioomides erineva sagedusega kasutades selleks kompositsionaalsete andmete analüüsimiseks mõeldud meetodeid. Kirjeldatakse kopositsionaalsete andmete jaoks mõeldud seose tugevuse näitajat uurimaks, kas soolestiku mikrobioomis on liike, mis esinevad soolestiku keskkonnas enamasti koos. Lisaks modelleeritakse prediabeedi esinemist logistilise regressiooni ning regulariseeritud logistilise regressiooniga.estopenAccessAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniapõhjuslik analüüsstatistilised mudelidmikroflooracausal analysisstatistical modelsmicroflorapõhjuslik analüüsstatistilised mudelidmikrofloorainfo:eu-repo/semantics/masterThesis