Browsing by Author "Sedman, Juhan"
Now showing 1 - 3 of 3
Results Per Page
Sort Options
Item Mitokondriaalse DNA helikaasi Irc3 funktsionaalne analüüs(Tartu Ülikool, 2016) Sillamaa, Sirelin; Sedman, Juhan; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutMitokonder omab eraldi genoomi, mille funktsioneerimises ja säilimises omavad olulist rolli erinevad valgud, nende hulgas ka helikaasid. S. cerevisiael on kirjeldatud kolm mitokondriaalset DNA helikaasi Pif1, Hmi1 ja Irc3. Irc3 on SF2 helikaas ja osaleb hargenud DNA metabolismis. Käesolevas bakalaureusetöös näidatakse, et RecG suudab osaliselt komplementeerida Irc3 deletsiooni. Analüüsisin samuti reaalaja qPCR-i kasutades Irc3 ja Cce1 deletsiooniga hüpersupressiivse a11 tüve mutante ja viisin läbi in silico katsed, mis näitavad, et bakteriofaag T4 helikaas UvsW on Irc3 kõige lähedasem homoloog.Item Rekombinatiivse helikaasi Irc3 C- ja N-terminaalsete domeenide funktsioonide analüüs(Tartu Ülikool, 2016) Paats, Joosep; Sedman, Juhan; Gaidutšik, Ilja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutMitokondriaalse DNA terviklikkus on vajalik aeroobseks hingamiseks. S. cerevisiae tuuma genoomilt kodeeritavad valgud on vajalikud mitokondriaalse DNA metabolismiks, nende hulgas ka helikaasid. DExH/D-box perekonna helikaas Irc3 on otseselt seotud S. cerevisiae mitokondriaalse DNA metabolismiga. Helikaaside lisadomeenid varieeruvad funktsioonilt ning struktuurilt. Antud töö eesmärk oli teostada Irc3 valgu N- ja Cterminaalsete domeenide biokeemiline analüüs. Tööst selgus, et Irc3 valgu N-terminaalne domeen on DNA poolt stimuleeritud ATP hüdrolüüsimise aktiivsusega, kuid C-terminaalne domeen mitte. C-terminaalne domeen seondus Holliday ühendust meenutava substraadiga sarnase afiinsusega kui metsiktüüpi Irc3 valk, kuid N-terminaalne domeen antud katsesüsteemis DNA-d märgatavalt ei sidunud.Item RNA-valk interaktsiooni uurimisest ribosoomis(Tartu : Tartu Riiklik Ülikool, 1982) Sedman, Juhan; Ustav, M., juhendaja; Järv, J., juhendaja