Fluorestsentsil põhineva antibiootikumi bioreporteri testimine bakteris Escherichia coli.

Abstract

Antibiootikumide toimet bakteritele uuritakse tavaliselt kõrgetel antibiootikumi kontsentratsioonidel, mis põhjustab bakterite kasvu peatumise või suremise. Kahel fluorestseeruval valgul põhinev reportersüsteem kasutab modifitseeritud trp liiderjärjestust ning võimaldab uurida bakterirakkude vastust translatsiooni inhibeerivate antibiootiliste ühenditele subinhibitoorsete kontsentratsioonide korral. Ma katsetasin seda bioreporterit uropatogeensetes Escherichia coli rakkudes, kasutades kahe fluorestseeruva valgu suhet signaalina. Nende valkude kõrge suhe viitab ribosoomi peatumisele antibiootikumi toimel. Reportersüsteem töötab, kuid ainult üldpopulatsiooni tasemel. Samas läbivoolutsütomeetria analüüs näitas, et on olemas ka suur bakterite alapopulatsioon, mis ekspresseerib vastavaid valke väga madalal tasemel ka tingimustes, kus antibiootikumi pole lisatud.