Escherichia coli ribosoomi biogeneesil osaleva RNA helikaasi CsdA substraadispetsiifika analüüs
Abstract
Ribosoom on ribonukleiinhape ja valgu kompleks, mille peamiseks funktsiooniks on valkude biosüntees. Escherichia coli ribosoom koosneb suuremast (50S) ja väiksemast alamühikust (30S). Ribosoomi biogenees on täpselt koordineeritud kiire protsess, mis hõlmab ribosomaalsetevalkude (r-valkude) ja ribosomaalse RNA (rRNA) sünteesi, küpsemist, keemilist modifitseerimist ja funktsionaalseks ribosoomiks assambleerumist. Ribosoomide biogeneesil osalevad ekstraribosomaalsed faktorid, mis aitavad kaasa subühikute assambleerumisele. Antud töös iseloomustatakse CsdA helikaasi roll ribosoomi biogeneesil.
CsdA on ATP-sõltuv RNA-helikaas, mis kuulub DEAD-box perekonda. See on
külmašokivalk, mille geeni kõrvaldamine genoomist põhjustab 50S subühiku eellaspartikli akumuleerumise madalatel temperatuuridel. Töö eesmärgiks on uurida, millist substraati kasutab CsdA valk ribosoomi assambleerumise käigus. Antud töös hinnatakse erinevate ribosoomipartiklite kui potentsiaalsete substraatide stimuleerivat mõju CsdA ATPaassele aktiivsusele.
Description
Keywords
RNA helikaas, CsdA, RNA, ribosoom, biogenees, DEAD