Telomeeride pikkuste seosed DNA metülatsiooniga
Kuupäev
2016
Autorid
Ajakirja pealkiri
Ajakirja ISSN
Köite pealkiri
Kirjastaja
Tartu Ülikool
Abstrakt
Viimastel aastatel on olnud palju uuringuid kromosoomide telomeerse DNA pikkuse seosega erinevates rakufunktsioonides alates raku vananemisprotesssi käivitamisest kuni kasvajate tekke indutseerimiseni.
Käesolevas töös uuriti metülatsioonitaseme ja telomeeride pikkuste vahelisi seoseid. Valim koosnes 747 indiviidist, kus kõige noorem oli 18-aastane ja kõige vanem 84-aastane. Selleks mõõdeti telomeeride suhteline keskmine pikkus Q-PCR meetodil ning mudeldati telomeeride pikkuse mõju DNA metülatsioonile.
Meta-analüüsi tulemustes epigenoomselt olulisi CpG saite välja ei tulnud. Siiski parimad viis leidu näitasid võimalikku seost DNA metülatsiooni taseme ja telomeeride pikkuse vahel. Nende hulgas näiteks MAP3K11 geen, mille puhul on varem näidatud, et see on oluline rakujagunemise regulatsioonil. Samuti tulid meta-analüüsi tulemustes välja potentsiaalselt huvitavad geenid MPP4, CABP7 ja MRPS6/SLC5A3, mida tuleks kinnitada teises kohordis.
Kirjeldus
Märksõnad
Telomeerid, DNA metülatsioon, telomeeride mõõtmismeetodid, EWAS, vananemine