Pseudomonas putida transporteri geeni lapE transkriptsiooni sõltuvus globaalsetest regulaatoritest
Date
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Käesolevas töös uuritakse Psedomonas putida geeni lapE transkriptsiooni sõltuvust
järgmistest globaalsetest regulaatoritest: Fis, PhoB ja RpoS. LapE moodustab LapB ja LapCga
kompleksi, mis transpordib kleepvalku LapA-d raku pinnale, võimaldades bakteril
kinnituda taime juurtele ning moodustada biofilmi. P. putida eelistab elada taime juurtel, sest
taim eritab oma juurte kaudu mulda mitmesuguseid bakteritele vajalikke toitaineid. Samal ajal
soodustab P. putida taime kasvu ning kaitseb seda patogeenide eest. Biofilmi moodustamine
on P. putida’le oluline protsess ning seepärast reguleeritakse seda mitmeid radu pidi.
Eelnevalt on põhjalikult uuritud P. putida biofilmi moodustamise regulatsiooni LapA
posttranslatsioonilise regulatsiooni kaudu. Biofilmi regulatsioonist transportervalkude kaudu
on aga vähe teada. Käesolevas töös leiab kinnitust, et lapE geeni ees on vähemalt kaks
promootorit, mis pole RpoS-st sõltuvad. Geeni lapE transkriptsioon ei sõltu PhoB-st LB
söötmes, kuid Fis reguleerib transkriptsiooni nii positiivselt kui negatiivselt.
Description
Keywords
Biofilm, Pseudomonas putida, Fis, LapE