dCas9-KRAB liitvalgu mõju AIRE partnervalkude ekspressioonile

Abstract

Autoimmuunhaiguste tekke vältimiseks toimub tüümuse säsi rakkudes autoantigeenide presenteerimine arenevatele T-rakkudele, mille käigus elimineeritakse autoreaktiivsed Trakud enne perifeersetesse kudedesse migreerumist. Autoantigeenide avaldumise eest tüümuses vastutab suures osas autoimmuunsuse regulaator AIRE. Oma funktsiooni saavutamiseks interakteerub AIRE mitmete partnervalkudega, millest paljusid on AIRE kontekstis vähe uuritud. Selles töös kasutatakse CRISPR interferents meetodit, et uurida valiku AIRE interaktsioonipartnerite geeniekspressiooni vaigistamise mõju AIRE sihtmärkgeenide ekspressioonile. Kasutatud AIRE-HEK/Tet mudelsüsteemis jõutakse mitmete valkude geeniekspressiooni alla reguleerimiseni, kuid muutust AIRE sihtmärkgeenide ekspressioonis ei nähtud.