Mikrobioomil põhinevad ennustusmudelid soolevähi diagnoosimiseks

Kuupäev

2021

Ajakirja pealkiri

Ajakirja ISSN

Köite pealkiri

Kirjastaja

Abstrakt

Inimesega seotud mikroorganismide ehk mikrobioomi uurimisvaldkond on muutunud väga oluliseks personaalmeditsiini arengus. Sellest lähtuvalt uuritakse bakalaureusetöös mikrobioomi kasutamist soolevähi diagnoosimiseks. Bakalaureusetöö eesmärk on luua soolevähi ennustusmudelid, kasutades lisaks klassikalistele soolevähi riskiteguritele soolestiku mikrobioomi andmeid. Mudelite koostamisel tutvustatakse Selbal metoodikat, mis on väljatöötatud mikrobioomi andmete analüüsimiseks. Meetodit kasutades luuakse soolevähi ennustusmudelid viie erineva populatsiooni andmetel ning hinnatakse prognoosimudelite ennustusvõimet soolevähi diagnoosimiseks ning mudelite üldistusvõimet teistesse populatsioonidesse.

Kirjeldus

Märksõnad

soolevähk, ennustusmudelid, mikrobioom, ROC-kõver, ROC-curve, colorectal cancer, microbiome, prediction models

Viide