Eesti jämesoolevähi sõeluuringu patsientide mikrobioomi koosluste erinevused soole koeproovides
Date
2021
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Inimese soolestiku mikrobioota on mitmekesine mikroorganismide kooslus, mis mõjutab meie
organismi erinevaid füsioloogilisi protsesse ja tervist. Samas võivad soolestiku mikrobioota
muutused mõjutada erinevate komplekshaiguste väljakujunemist. Üks nendest haigustest on
jämesoolevähk (CRC), kus mikrobioomi analüüsimine varajases staadiumis esinevatest
healoomulistest polüüpidest võib anda olulist teavet jämesoolevähi varajaseks
diagnoosimiseks. Töö käigus analüüsiti Eesti jämesoolevähi sõeluuringu raames kogutud
jämesoole koeproovide mikrobioomi koosseisu. Tulemustena selgus, et enimesinevad
hõimkonnad ja perekonnad on samasugused kõikides koetüüpides peale vähkkoe ning
mikroobne mitmekesisus terve epiteel- ja polüübikoe suhtes ei erine. Täpsemate
mikroobikoosluste muutuste tuvastamiseks tuleb edaspidi kaasata uuringusse suurem valim
koos erinevat tüüpi kogutud proovidega.
Description
Keywords
mikrobioom, mikrobioota, jämesoolevähk, 16S rRNA sekveneerimine