Browsing by Author "Sein, Hanna"
Now showing 1 - 2 of 2
- Results Per Page
- Sort Options
Item dCas9-KRAB liitvalgu mõju AIRE partnervalkude ekspressioonile(Tartu Ülikool, 2019) Sein, Hanna; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutAutoimmuunhaiguste tekke vältimiseks toimub tüümuse säsi rakkudes autoantigeenide presenteerimine arenevatele T-rakkudele, mille käigus elimineeritakse autoreaktiivsed Trakud enne perifeersetesse kudedesse migreerumist. Autoantigeenide avaldumise eest tüümuses vastutab suures osas autoimmuunsuse regulaator AIRE. Oma funktsiooni saavutamiseks interakteerub AIRE mitmete partnervalkudega, millest paljusid on AIRE kontekstis vähe uuritud. Selles töös kasutatakse CRISPR interferents meetodit, et uurida valiku AIRE interaktsioonipartnerite geeniekspressiooni vaigistamise mõju AIRE sihtmärkgeenide ekspressioonile. Kasutatud AIRE-HEK/Tet mudelsüsteemis jõutakse mitmete valkude geeniekspressiooni alla reguleerimiseni, kuid muutust AIRE sihtmärkgeenide ekspressioonis ei nähtud.Item Saccharomyces cerevisiae mudelsüsteemi konstrueerimine uurimaks histoon H3 atsetüleerimise olulisust kaheahelalise DNA katke parandamises(Tartu Ülikool, 2017-06-10) Sein, Hanna; PhD, Kadri Peil, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutPagaripärmi iga rakutsükli G1 faasis toimub HO-endonukleaasi indutseeritud DNA kaheahelalise katke tegemine, mis algatab paardumistüübi vahetuse. Selle katke parandamine toimub geenikonversiooni mehhanismiga. Laboratoorsetes tüvedes on HO-endonukleaasi ekspressioon tavaliselt inaktiveeritud. Käesolevas töös aga kasutatakse galaktoosi kontrolli all oleva promootoriga HO-endonukleaasi tehtud lõiget kaheahelalise katke parandamise uurimiseks mutantsete histoonidega S. cerevisisae tüvedes, kus valitud lüsiinijäägid histoonil H3 on muteeritud arginiinideks (K9R, K14R, K23R ja kolmekordne mutant K9,14,23R). Töö käigus leiti, et kõige tundlikum kaheahelalistele katketele on H3K9,14,23R mutatsioonidega tüvi. Üksikmutantide puhul efekti ei nähtud.