Sirvi Autor "Sidorenko, Julia" järgi

Tulemuste filtreerimiseks trükkige paar esimest tähte
Nüüd näidatakse 1 - 3 3
  • Pisipilt
    Kirje
    Combating DNA damage and maintenance of genome integrity in pseudomonads
    (2015-09-16) Sidorenko, Julia
    Efektiivne DNA replikatsioon ja DNA kahjustuste eemaldamine on erakordse tähtsusega elusrakkude genoomi terviklikkuse säilitamisel. Kõrgelt koordineeritud DNA reparatsiooni mehhanismid võimaldavad rakkudel ellu jääda ka ulatuslike rakuväliselt indutseeritud DNA kahjustuste korral, kuid on ilmselgelt olulised ka spontaanselt tekkivate DNA kahjustuste kõrvaldamisel. Nukleotiidi väljalõike reparatsioon (NER) on üks põhilisi DNA reparatsioonisüsteeme, kus UvrA, UvrB, UvrC ja UvrD valkude toimel eemaldatakse DNA kaksikahelast 12-13 nukleotiidi pikkune üksikahelaline DNA kahjustust sisaldav lõik ning seejärel sünteesib DNA polümeraas I (Pol I) selle asemele uue DNA ahela. Pol I põhifunktsiooniks rakus on DNA replikatsioonil RNA praimerite eemaldamine ja nende asemele uute DNA lõikude süntees. DNA kahjustuste korral osaleb Pol I ka reparatsioonilisel DNA sünteesil. Seega on nii NER kui ka Pol I olulised geneetilise informatsiooni säilitamiseks rakkude paljunemisel. Doktoritöös uuriti NER, Pol I ning samuti ka DNA-d kahjustatavate ühendite rakkudest aktiivse väljaviimise osalust genoomi terviklikkuse tagamisel pseudomonaadides, mullabakteris Pseudomonas putida ning oportunistlikus inimese patogeenis P. aeruginosa. Uuringute tulemusena selgus, et NER valkude puudumisel suureneb oluliselt homoloogilise rekombinatsiooni (HR) sagedus P. putida kromosoomis ning väheneb rakkude eluvõime. Samas tekivad NER-defektsuse korral kiiresti kompensatoorsed mutatsioonid, mis taastavad bakterite normaalse kasvu ja vähendavad HR-i sagedust. Sellist efekti NER valkude puudumisele ei ole teistes organismides varem kirjeldatud. Teiseks selgus uurimistööst, et Pol I on seni arvatust olulisem endogeenselt tekkivate reaktiivsete hapniku radikaalide tolereerimisel. Samuti ilmnes, et Pol I puudumisel osalevad DNA sünteesil spetsialiseeritud DNA polümeraasid Pol II, Pol IV ja DnaE2. Lisaks selgus, et P. aeruginosa PAO1 liini laboratoorsete tüvede puhul toimub rakke kahjustavate kemikaalide rakkudest välja viimine erineva efektiivsusega. Selline varieeruvus mõjutab bakterite tundlikkust DNA-d kahjustatavatele ühenditele ja antibiootikumidele ning raskendab oluliselt erinevate töörühmade poolt saadud tulemuste võrdlust.
  • Pisipilt
    Kirje
  • Pisipilt
    Kirje