Browsing by Author "Tagel, Mari"
Now showing 1 - 7 of 7
- Results Per Page
- Sort Options
Item Finding novel factors affecting the mutation frequency: a case study of tRNA modification enzymes TruA and RluA(2022-11-02) Tagel, Mari; Kivisaar, Maia, juhendaja; Ilves, Heili, juhendaja; Remme, Jaanus, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondBakterid suudavad elada kõikjal, kuid karmide ja muutlike keskkonnatingimustega kohanemiseks on aga vaja geneetilist varieeruvust. Bakterites on selle põhiliseks allikaks mutatsioonid. Evolutsiooni mõistmiseks on vaja selgitada molekulaarseid mehhanisme, mis mõjutavad mutatsioonide tekkesagedust. Käesolevas töös kirjeldasin ja analüüsisin uut testsüsteemi, mis võimaldab tuvastada mutatsioonisagedust mõjutavaid faktoreid bakteriperekonnas Pseudomonas. Kirjeldatud testsüsteemi abil õnnestus mullabakteris Pseudomonas putida tuvastada nii varem kirjeldatud kui ka uusi mutatsioonisagedust mõjutavaid geene. Üllatavaim leid oli tRNA modifikatsiooniensüümide TruA ja RluA mõju mutatsioonisagedusele. tRNAd on väikesed molekulid, mis valgusünteesil kannavad valkude ehituskive ribosoomi. Selleks, et paremini oma funktsiooni täita, on paljud nukleotiidid tRNAdes modifitseeritud. Modifikatsioonidel võib olla palju ülesandeid, näiteks aitavad modifikatsioonid tRNAdel saavutada õiget struktuuri või suurendavad translatsiooni täpsust. TruA ja RluA modifitseerivad U nukleotiidi pseudouridiiniks, tehes seda erineval poolel tRNA antikoodonist. Näitasime, et TruA ja RluA tehtud modifikatsioonide puudumisel suureneb P. putidas mutatsioonisagedus. Mõistmaks paremini nende ensüümide olulisust, analüüsisime translatsiooni täpsust, stressi taluvust, proteoomi ja üldist elulemust P. putida TruA ja RluA defektsetes tüvedes. Lisaks sellele selgitasime võrdlevalt TruA ja RluA rolle ka Pseudomonas aeruginosa ja Escherichia coli rakkudes. Saadud tulemustest on näha, kuidas konserveerunud funktsiooniga valgud võivad põhjustada erinevates bakterites erinevaid fenotüüpe. Samuti ilmestab käesolev töö, kuivõrd mitmekesised ja ootamatud tegurid võivad mõjutada DNAs mutatsioonide teket.Item Geneetika praktikumi juhend(Tartu Ülikooli Kirjastus, 2020) Ilves, Heili; Hõrak, Rita; Jõers, Priit; Saumaa, Signe; Ukkivi, Kärt; Tagel, Mari; Ilmjärv, Tanel; Tover, AndresItem Papillide tekkel põhineva testsüsteemi kasutatavus perekond Pseudomonas bakterites(Tartu Ülikool, 2016) Agur, Gabriel; Ilves, Heili; Tagel, Mari; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutEvolutsiooni paremaks mõistmiseks on oluline kindlaks teha mutatsiooniprotsesse mõjutavad tegurid. Mutatsioonide uurimiseks on meie grupis välja töötatud papillide tekkel põhinev testsüsteem lac-lsc, mida hetkel on kasutatud ainult mullabakteris Pseudomonas putida PaW85. Käesolevas bakalaureusetöös selgitatan välja lac-lsc testsüsteemi kasutatavuse erinevates bakteriperekond Pseudomonas liikides.Item Practical Course in Genetics(University of Tartu Press, 2020) Ilves, Heili; Hõrak, Rita; Jõers, Priit; Saumaa, Signe; Ukkivi, Kärt; Tagel, Mari; Ilmjärv, Tanel; Tover, AndresItem Relationships between domestic violence and other socio-sconomic problems in Estonia(Tartu Ülikool, 2015) Tagel, Mari; Pagan, Hector C., juhendaja; Tartu Ülikool. Sotsiaal- ja haridusteaduskond; Tartu Ülikool. Riigiteaduste instituutItem Uute mutatsioonisagedust mõjutavate geenide identifitseerimine bakteris Pseudomonas putida(Tartu Ülikool, 2014-06-17) Tagel, Mari; Kivisaar, Maia, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut