Browsing by Author "Tammeveski, Lauri"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Item
    DNA mutatsiooniliste signatuuride õppimine tehisnärvivõrkude abil
    (2016) Tammeveski, Lauri; Zafra, Raul Vicente; Parts, Leopold; Matiisen, Tambet; Tampuu, Ardi
    Kõik pahaloomulised vähkkasvajad on põhjustatud organismi rakkudes\n\rtoimuvate mutatsioonide poolt. On leitud, et need mutatsioonid\n\ron moodustatud spetsiifiliste mustrite ehk signatuuride kombinatsioonist,\n\rmille aluseks olevad protsessid on tihti teada. Seetõttu on nende\n\rsignatuuride õppimine andmetest väga tähtis — see võib anda paremat\n\rinformatsiooni vähkkasvajate mehhanismide kohta ja olla abiks\n\rvähi ennetamisel ja teraapial. Antud töö eesmärk on testida ja võrrelda\n\rerinevaid metoodikaid, et parandada mutatsiooniliste signatuuride\n\rleidmist. Me võrdlesime kolme uut meetodit — tehis-närvivõrgud\n\r(NN), mittenegatiivsed faktorvõrgud (RFN) ja teemade modelleerimine\n\r— praegu kasutatava mittenegatiivse maatriksi faktoriseerimisega\n\r(NMF). Me eksperimenteerisime meetoditega kolmel orgaanilisel ja kolmel\n\rsünteetilisel andmestikul ning mõõtsime rekonstrueerimise viga, tulemuse\n\rhõredust ja arvutusteks kulunud aega. Tulemused näitavad, et\n\rNMF annab väikseima veaga tulemuse kergematel andmestikel, kuid ka\n\rRFN-i tulemus on ligilähedane ning kõikidel teistel andmestikel saavutab\n\rsee parema tulemuse. NN esineb sama hästi kui RFN keerulisematel\n\randmestikel ning lisaks saavutab üleüldiselt kõige hõredamad tulemused.\n\rNMF-i eeliseks on stabiilsuse arvutamise funktsionaalsus, mis väga\n\rtäpselt suudab määrata õige signatuuride arvu. Tulevikus tuleb teha\n\redasist arendustööd, et sarnane võimekus ka RFN ja NN meetoditele\n\rlisada, mille järel oleks võimalik nende praktiline kasutamine mutatsiooniliste\n\rsignatuuride õppimisel.
  • Thumbnail Image
    Item
    Eestikeelse jalgpalli-alase tekstikorpuse automaatne märgendamine jalgpalli-alase Frameneti abil
    (2014) Tammeveski, Lauri; Kahusk, Neeme
    Käesoleva töö eesmärgiks on uurida ning üritada lahendada eestikeelse teksti automaatse freimidega märgendamise probleemi. Üldine eestikeelne Framenet on alles algusjärgus, kuid olemas on terviklik jalgpalli-alane freimide ressurss, mille abil üritame tõestada hüpoteesi, et jalgpalli-alase teksti märgendamiseks piisab vaid morfoloogilisest ning süntaktilisest infost. Sellele hüpoteesile me siiski kinnitust ei saanud, kuna sama tähendust kandvat lauset on võimalik esitada liiga paljudel erinevatel viisidel. Lisaks täiendasime jalgpalli-alaste sõnadega Eesti suurimat leksikaal-semantilist andmebaasi, Wordnetti.