Sirvi Autor "Varik, Ronald" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 2 2

Pagaripärmi ribosoomi peptidüültransferaasi keskuse piirkonnas paiknevate evolutsiooniliselt konserveerunud rRNA modifikatsioonide mõju temperatuuritundlikkusele
(Tartu Ülikool, 2025) Varik, Ronald; Leppik, Margus, juhendaja; Tamm, Tiina, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Ribosoomi koostises olevad RNA molekulid sisaldavad palju modifitseeritud nukleotiide. Ribosomaalse RNA modifikatsioonidel on tähtis roll ribosoomi funktsiooni optimeerimisel. Väikesed tuumakese RNA-d ehk snoRNA-d on üheks viisiks, kuidas rRNA modifikatsioonide muster määratakse. Eriti tähtis roll on omistatud modifikatsioonidele, mis asuvad ribosoomi funktsionaalsetes piirkondades nagu näiteks peptidüültransferaasi keskuses. PTC-s leidub nii evolutsiooniliselt konserveerunud rRNA modifikatsioone kui ka mittekonserveerunud modifikatsioone. Käesolevas töös selgitatakse, kuidas nelja konserveerunud PTC modifikatsiooni (Ψ2826, Um2921, Gm2619, m5C2870) puudumine mõjutab S. cerevisiae külmatundlikkust.
Yaf9 valgu vajalikkus DNA kaheahelaliste katkete parandamisel pagaripärmis Saccharomyces cerevisiae
(Tartu Ülikool, 2023) Varik, Ronald; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Yaf9 on üks kolmest YEATS domeeni sisaldavast valgust pagaripärmis ja on osa kahest valgu kompleksist, mis teostavad kromatiini modifikatsioone. Yaf9 pole pärmi eluks ega kasvuks vajalik valk, kuid Yaf9 mängib olulist rolli DNA kaheahelaliste katkete parandamisel. Yaf9W89A mutandi DNA kaheahelalise katke parandamise efektiivsust võrreldi metsiktüüpi Yaf9 ja Yaf9 deletsiooni tüvedega.