Browsing by Author "Venta, Rainis"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Studies on signal processing by multisite phosphorylation pathways of the S. cerevisiae cyclin-dependent kinase inhibitor Sic1(2018-08-21) Venta, Rainis; Loog, Mart, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondRakkude jagunemine käivitatakse DNA-sünteesi algatamisega. See toimub aga alles siis, kui rakud on valmis kogu järgneva raku jagunemise tsükli peatumata läbi tegema. Rakkude jagunemise käivitavad ja kogu edasist protsessi juhivad tsükliinsõltuvad kinaasid (Tsk). Need on valgud, mis kontrollivad teiste valkude asukohta, eluiga või aktiivsust neile foforhappejääke lisades. Rakutsükli etapid käivitatakse erinevate kindla spetsiifikaga Tsk komplekside poolt. Rakkude jagunemist kontrolliva mehhanismi uurimiseks kasutatakse laialdaselt mudelorganismina pagaripärmi S. cerevisiae, mille jagunemise tsükli üldine ülesehitus meenutab lihtsustatult inimese rakkudes toimuvat. Pärmirakkude kasvufaasi (G1) käigus rakud akumuleerivad mitmeid Tsk´se. Osad TSK´d on koheselt aktiivsed ning asuvad oma sihtmärke fosforüülima, valmistades rakku S-faasiks ette. Osad Tsk´d, mille aktiivust läheb tarvis alles S-faasi käivitamiseks ja läbiviimiseks, toodetakse inhibeeritud olekus. Nende aktiivsus on blokeeritud valgu Sic1 poolt. Kogu S-faasi käivitamiseks vajalik Tsk toodetakse kasvufaasis tihedalt kompleksis Sic1 valguga, et vältida juhuslikku S-faasi käivitava aktiivsuse lekkimist enne õiget aega. S-faasi käivitamiseks tuleb Sic1 lagundada, mis vabastab S-faasi spetsiifilise Tsk aktiivsuse. Sic1 ise on Tsk´de sihtmärk ja sisaldab palju fosforüülimiseks sobivaid aminohappeid. Nende fosforüülimine suunab Sic1 lagundamisele, mis määrab S-faasi käivitamise ajastuse ja dünaamika ning on üheks keskseks osaks rakutsükli reguleerimise mehhanismis. Varasemalt ei olnud teada, millised kinaasid millise dünaamikaga Sic1 fosforüülivad ning seetõttu puudus detailne mudel, kuidas seeläbi saavutatakse kontroll raku jagunemise käivitamise üle. Käesoleva uurimistöö käigus selgitati välja, mis kinaasid ja millise dünaamikaga Sic1 valku fosforüülivad. Sellega avastastasid uurimistöö autorid kvantitatiivse S-faasi käivitamise kontrollmehhanismi, mis reguleerib minutilise täpsusega rakkude jagunemise algust ja tagab selle käivitamiseks piisava koguse Tsk aktiivsust. Selle mehhanismi keskne osa – mitmiksfosforüülitav valk Sic1 – toimib mikrokiibina, mis salvestab kasvufaasis olevas rakus jagunemist toetavad ja takistavad signaalid. Neid signaale tõlgendatakse S-faasi käivitamise ajaks ja dünaamikaks S-faasi käivitava Tsk poolt Sic1 sidumise käigus.