Sirvi Kuupäev , alustades "2017-04-05" järgi

Filtreeri tulemusi aasta või kuu järgi

Nüüd näidatakse 1 - 1 1

Application of isothermal amplification methods for detection of Chlamydia trachomatis directly from biological samples
(2017-04-05) Jevtuševskaja, Jekaterina; Langel, Ülo, juhendaja; Uusna, Julia, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond
Praeguseks on teada enam kui 30 erinevat sugulisel teel levivat bakterit, viirust ja parasiiti, kes kõik võivad nakatada kahjustades reproduktiivorganeid. Üheks peamiseks probleemiks on nenede patogeenidega nakatamise aladiagnoos, sest valdavalt kulgevad suguhaigused asümptomaatiliselt. Avastamata ja ravimata suguhaigused võivad põhjustada pikaajalisi ebamugavusi või viia hoopis tervistkahjustavate tagajärgedeni, näiteks tekitada põletikku emakakaelas, munajuhas või kusitis, suurendada emakaväliseraseduse ja isegi viljatuse tõenäosus. Selleks, et võimalikke tüsistusi vähendada on oluline haiguse õigeaegne ravi. Selleks on vajalik patogeenide kiire ja täpne diagnoosimine. Antud projekti eesmärgiks oli arendada ja optimeerida kiire, täpne ning usaldusväärne isotermilise amplifikatsiooni meetod sugulisel teel leviva bakteri C. trachomatise tuvastamiseks otse uriinist, mida oleks võimalik tulevikus rakendada kodukasutuseks mõeldud kiirtestides. Kuna tänapäeval puuduvad täpsed ning usaldusväärsed kiirtestid C. trachomatise tuvastamiseks otse uriinist (tundlikkus on 40% ulatuses, sõltudes bioloogilisest materjalist) on väga oluline selle suuna edasine arendamine. Samas ka bioloogilise materjali eeltöötlusest sõltub olulisel määral eduka patogeense DNA vabastamine rakust ja selle järgnev tuvastamine, seega on ka selle optimeerimine väga oluline. Isotermilised amplifikatsiooni meetodi abil nagu RPA ja LAMP oleks aga võimalik luua platformi kiire, täpse ning usaldusväärse C. trachomatise tuvastamiseks otse bioloogilisest materjalist. RPA meetod suudab kasutada bioloogilise materjali lüüsimiseks kuumust, samas kui LAMP meetodiga on võimalik patogeenset DNA vabastamist ka antimikroobsete peptiidide abil. Suutsime näidata, et isotermilise amplifikatsiooni meetodid nagu RPA ja LAMP tänu oma eelistele nagu tundlikkus, spetsiifilisus, kiirus, täpsus, odavus ning lihtsus saaks optimeerimise järel rakendada tulevikus kiirtestides nii C. trachomatise kui ka erinevate patogeenide tuvastamiseks otse bioloogilisest materjalist.