Sirvi Kuupäev , alustades "2017-04-21" järgi

Filtreeri tulemusi aasta või kuu järgi

Nüüd näidatakse 1 - 2 2

The Williams-Beuren syndrome chromosome region protein WBSCR22 is a ribosome biogenesis factor
(2017-04-21) Õunap, Kadri; Kurg, Reet, juhendaja; Kurg, Ants, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond
Ribosoomide biogeneesil osaleb ligi 300 valku, millest ligi kolmandik on seotud genoomsete haiguste ja kasvajate tekkega. Williams-Beureni sündroom (WBS) on arenguhäire, mida põhjustab umbes 30 geeni sisaldava regiooni puudumine seitsmendast kromosoomist. WBS patsientidel esineb rida erivaid probleeme – südame-veresoonkonna haigused, sidekoe arenguhäired, neuroloogilised probleemid, spetsiifiline kognitiivne profiil, kasvuprobleemid ja iseloomulikud näojooned. Ümberkorraldused WBS kromosoomiregioonis tekivad madalakoopiaarvuliste kordusjärjestuste esinemise tõttu, kuid hetkel pole teada, kuidas üksikute geenide koopiaarvu muutus põhjustab haigustunnuseid. Arvatakse, et paljud geenid on olulised WBS-i tekkel, mistõttu on vajalik nendelt geenidelt ekspresseeritavate valkude funktsioonide uurimine. Üheks WBS lookusest avalduvaks valguks, mille funktsioon enne antud töö raames sooritatud katsete tegemist oli teadmata, on WBSCR22. WBSCR22 iseloomustamine on oluline ka seetõttu, et tema avaldumistase on tõusnud mitmete kasvajate korral ja on teada, et ta mõjutab kasvajarakkude elulemust ja metastaaside teket. Antud doktoritöö esimese osa eesmärgiks oli WBSCR22 funktsiooni uurimine imetaja rakkudes. Leiti, et WBSCR22 valk asub hajusalt rakutuumas, kuid esineb ka valgu kogunemist tuumakesse – piirkonda, kus toimub ribosomaalse RNA (rRNA) süntees ja algab ribosoomide biogenees. Doktoritöös leiti, et WBSCR22 on oluline rakkude kasvuks, ribosoomi väikese subühiku biogeneesiks ja pre-rRNA protsessinguks. Täpsemalt, WBSCR22 ekspressiooni allareguleerimine põhjustab küpse 18S rRNA viimase eellase, 18S-E pre-rRNA, kuhjumist raku tuumas. See toob kaasa 18S rRNA ja ribosoomi väikese subühiku hulga vähenemise tsütoplasmas, mis võib viia rakkude aeglase jagunemiseni. Doktoritöös leiti, et üheks WBSCR22-ga seonduvaks valguks on TRMT112. TRMT112 paiknemine rakus on määratud WBSCR22 poolt: WBSCR22-TRMT112 kompleks asub raku tuumas ning kompleksi teke on vajalik WBSCR22 stabiilsuseks. TRMT112 hulga vähenemisel suunatakse WBSCR22 lagundamisele. Doktoritöö teises osas analüüsiti retroviiruste Gag valgu poolt indutseeritud viiruslaadsete partiklite (VLP-de) valgulist koostist ning avastati, et nendes VLP-des esineb suur hulk rakulisi valke, sealhulgas ribosoomivalke, kuid nende roll VLP-des ei ole teada.
Analysis of Remote Sensing Image Super Resolution using Fluid Lenses
(2017-04-21) Rasti, Pejman; Anbarjafari, Gholamreza, juhendaja; Keifer, Rudolf, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond
Käesolevas doktoritöös uuriti nii riist- kui ka tarkvaralisi lahendusi piltide töötlemiseks. Riist¬varalise poole pealt pakuti lahenduseks uudset vedelläätse, milles on dielekt¬rilisest elastomeerist kihilise täituriga membraan otse optilisel teljel. Doktoritöö käigus arendati välja kaks prototüüpi kahe erineva dielektrilisest elastomeerist ki¬hilise täituriga, mille aktiivne ala oli ühel juhul 40 ja teisel 20 mm. Läätse töö vas¬tas elastomeeri deformatsiooni mehaanikale ja suhtelistele muutustele fookuskau¬guses. Muutuste demonstreerimiseks meniskis ja läätse fookuskauguse mõõtmiseks kasutati laserkiirt. Katseandmetest selgub, et muutuste tekitamiseks on vajalik pinge vahemikus 50 kuni 750 volti. Tarkvaralise poole pealt pakuti uut satelliitpiltide parandamise süsteemi. Paku¬tud süsteem jagas mürase sisendpildi DT-CWT laineteisenduse abil mitmeteks sagedusalamribadeks. Pärast müra eemaldamist LA-BSF funktsiooni abil suu¬rendati pildi resolutsiooni DWT-ga ja kõrgsagedusliku alamriba piltide interpo¬leerimisega. Interpoleerimise faktor algsele pildile oli pool sellest, mida kasutati kõrgsagedusliku alamriba piltide interpoleerimisel ning superresolutsiooniga pilt rekonst¬rueeriti IDWT abil. Käesolevas doktoritöös pakuti tarkvaraliseks lahenduseks uudset sõnastiku baasil töötavat super-resolutsiooni (SR) meetodit, milles luuakse paarid suure resolutsiooniga (HR) ja madala resolut-siooniga (LR) piltidest. Kõigepealt jagati vastava sõnastiku loomiseks HR ja LR paarid omakorda osadeks. Esialgse HR kujutise saamiseks LR sisendpildist kombineeriti HR osi. HR osad valiti sõnastikust nii, et neile vastavad LR osad oleksid võimalikult lähedased sisendiks olevale LR pil¬dile. Iga valitud HR osa heledust korrigeeriti, et vähendada kõrvuti asuvate osade heleduse erine¬vusi superresolutsiooniga pildil. Plokkide efekti vähendamiseks ar¬vutati saadud SR pildi keskmine ning bikuupinterpolatsiooni pilt. Lisaks pakuti käesolevas doktoritöös välja kernelid, mille tulemusel on võimalik saadud SR pilte teravamaks muuta. Pakutud kernelite tõhususe tõestamiseks kasutati [83] ja [50] poolt pakutud resolutsiooni parandamise meetodeid. Superreso¬lutsiooniga pilt saadi iga kerneli tehtud HR pildi kombineerimise teel alpha blen¬dingu meetodit kasutades. Pakutud meetodeid ja kerneleid võrreldi erinevate tavaliste ja kaasaegsete meetoditega. Kvantita-tiivsetest katseandmetest ja saadud piltide kvaliteedi visuaal¬sest hindamisest selgus, et pakutud meetodid on tavaliste kaasaegsete meetoditega võrreldes paremad.