Sirvi Kuupäev , alustades "2019-07-05" järgi

Filtreeri tulemusi aasta või kuu järgi

Nüüd näidatakse 1 - 2 2

Imprinting disorders in Estonia
(2019-07-05) Yakoreva, Maria; Õunap, Katrin, juhendaja; Kahre, Tiina, juhendaja; Tartu Ülikool. Meditsiiniteaduste valdkond
Kaasasündinud vermimishäired on vähetuntud rühm harva esinevaid pärilikke haigusi, mis on tingitud vermitud geenide ekspressiooni muutustest ning mõjutavad peamiselt kasvu, aju funktsioone ja hormonaalset süsteemi. Kuigi inimese genoomis on leitud vähemalt 100 vermitud geeni, on hetkel teada ainult 13 kliiniliselt tunnustatud kaasasündinud vermimishäiret. Nendest sagedasemad on Prader-Willi sündroom (PWS), Angelmani sündroom (AS), Beckwith-Wiedemanni sündroom (BWS) ning Silver-Russelli sündroom (SRS). Kuigi igale vermimishäirele on iseloomulik spetsiifiline kliiniline pilt, on sümptomid sageli kattuvad, ebatüüpilised või vähe väljendunud. Ka molekulaarsed põhjused võivad olla nii geneetilised kui ka epigeneetilised. Varieeruva molekulaarse etioloogia ja kliinilise avaldumise tõttu on vermimishäirete diagnostika keeruline, mistõttu osa vermimishäirete juhtudest jääb diagnoosimata. Käesoleva uuringuga selgitati sagedamini esinevate vermimishäirete esinemissagedust Eestis. Leiti, et PWS, AS ning BWS esinemissagedus Eestis on võrreldav kirjanduses publitseeritud esinemissagedusega, kuid SRS ning GNAS-geeniga seotud vermimishäirete esinemissagedus on eeldatavast oluliselt kõrgem. Demonstreeriti, et kuigi iga vermimishäire eraldi võetuna on väga harva esinev, on kõik vermimishäired koos suhteliselt levinud. Molekulaarselt kinnitati diagnoos 38%-l kliinilise SRS diagnoosiga patsientidest ning 8%-l kliinilise BWS diagnoosiga patsientidest, mis näitab, et SRS skooringusüsteem on Eesti patsientidel efektiivsem kui BWS skooringusüsteem. Juurutati laboripraktikasse selliseid uusi molekulaarseid teste nagu 6., 7., 14. ja 20. kromosoomi vermitud regioonide MS-MLPA (ingl Methylation-Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) analüüsid, ning kirjeldati nende analüüsidega leitud haruldasi vermimishäireid Eestis. Käesoleva uurimistöö tulemusena õnnestus parandada vermimishäirete diagnostikat Eestis ning ka tõsta Eesti arstide teadlikkust vermimishäiretest.
Standard substance free quantification for LC/ESI/MS analysis based on the predicted ionization efficiencies
(2019-07-05) Liigand, Jaanus; Kruve-Viil, Anneli, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond
Kõrgefektiivne vedelik kromatograafia elektropihustus massispektromeetria (LC/ESI/MS) on laialt kasutatud väga võimekas analüüsimeetod. Antud meetod on levinud orgaaniliste ühendite, eriti jälgedes, määramise meetod. Kahjuks on sellel meetodil üks puudus. Kõrgefektiivse vedelikkromatograafi ja massispektromeetri ühendamiseks kasutatava elektropihustuse ionisatsiooniefektiivsus on ühendist sõltuv ja võib erineda üle 10 miljoni korra. Ionisatsiooniefektiivsus on defineeritud lahuses olevate analüüdi molekulidest või ioonidest genereeritud gaasifaasiliste ioonide määrana. Seepärast tuleb LC/ES/MS kvantitatiivseks kasutamiseks kasutada standardaineid. Kahjuks ei pruugi standardained kättesaadavad olla, kui tegemist on uudse avastusega, antud ühendeid on raske eraldada või nad on ebastabiilsed. Minu doktoritöö eesmärgiks on arendada arvutuslik meetod elektropihustuse ionisatsiooniefektiivsuste ennustamiseks, et võimaldada standardainete vaba kvantitatiivset suunamata LC/ESI/MS analüüsi. Standardainete vaba kvantiseerimise võimaldamiseks uurisin aine struktuuri mõju ionisatsiooniefektiivsusele. Lisaks uurisin analüüsiks kasutatud eluendi mõju ionisatsiooni efektiivsusele. Oma doktoritöö raames näitasin, et mõõdetud ionisatsiooniefektiivsused ning nende trendid erinevate ainete klassides ja erinevates analüüsiks kasutatud eluentides on erinevate instrumentide ülesed. Lõpuks töötasin välja ionisatsiooniefektiivsuse ennustamise mudeli ning meetodi, mis võimldab standardainete vaba kvantiseerimist LC/ESI/MS analüüsil