Sirvi Märksõna "ARC" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 3 3

listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
ARC-LUM ühendite fotoluminestsentsomaduste uurimine tahkes polümeermaatriksis
(Tartu Ülikool, 2017) Jõgela, Joana; Enkvist, Erki; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Keemia instituut
Magistritöö eesmärgiks oli uurida ARC-Lum ühendite luminestsentsomadusi polüvinüülalkoholis, jätkuna bakalaureusetööle „Mudelainete süntees Försteri distantsi uurimiseks ARC-Lum(Fluo) sondides“. OLED-ite ning fosforestsentskiirgusel põhinevate sensorite areng on viimastel aastakümnetel olnud märgatav, seetõttu sooviti uurida, kas ARC-Lum ühendid sobiksid sellisteks rakendusteks. Selleks sünteesiti erineva doonor- ja aktseptorluminofoori vahelise distantsiga ARC-Lum(Fluo) ühendite seeria ja uuriti nende luminestsentssignaalide eluigasid PVA-s. Samuti võeti kasutusele uus mõõtesüsteem ning sellega kaasnevalt muudeti proovi ettevalmistuse meetodit. Lisaks teostati hulgaliselt paralleel- ja kordusmõõtmisi andmete korratavuse kontrollimiseks ja usaldusväärsuse tõstmiseks. Mõõdeti fosforestsentsi eluead ka neljale ARC-Lum(-) ühendile, mida varem polnud õnnestunud teha. Viimasena uuriti ARC-Lum(Fluo) kui ka ARC-Lum(-) ühendite luminestsentskiirguse temperatuuri sõltuvust ja fotostabiilsust.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Development of protein kinase inhibitors based on adenosine analogue-oligoarginine conjugates
(2010-10-04) Lavõgina, Darja
Valkude fosforüleerimisreaktsioon elusorganismides ning seda katalüüsivad valgud – proteiinkinaasid – on olnud loodusteadlaste tähelepanu keskpunktis alates 1950-test aastatest, kui E. P. Kennedy, E. H. Fischeri, E. G. Krebsi, E. W. Sutherlandi ja W. D. Wosilaiti tööd avasid kinaaside ajastu [Cohen P., 2002]. Proteiinkinaasid osalevad enamikes raku elutegevuseks olulistes protsessides, seetõttu on häired nende ensüümide funktsioneerimises (eriti kõrgendatud aktiivsus) seotud mitmete haigustega (sealhulgas vähkkasvajad, diabeedid ja astma). Sellest tulenevalt keskenduvad nii akadee¬miliste teadlaste kui ka farmaatsiafirmade ravimiarendajate huvid üha enam kinaaside toimemehhanismide uurimisele ja võimaluste selgitamisele rakusiseste valkude fosforüleerimistasakaalude mõjutamiseks. Viimase ülesande lahendamisel on üheks perspektiivsemaks teeks proteiinkinaaside inhibiitorite arendus. Käesolev töö kirjeldab adenosiini analoogi ja arginiinirikka peptiidi konjugaatide (ARC-de) arendamist proteiinkinaaside bisubstraatseteks kõrge inhibeerimispotentsiaaliga ligandideks, nende inhibiitorite disaini ja sünteesi. Uudsete ARC-de arendamisel lähtuti tulemustest, mis saadi inhibiitorite struktuuri mõju uurimisel nende sidumis- või inhibeerimisomadustele toimes cAMP-sõltuva proteiinkinaasiga (PKA) ning sama proteiinkinaasi ARC-dega kooskristalliseerimisel saadud struktuuride röntgenanalüüsil. Töö tulemusena õnnestus valmistada kaks uut ARC-tüüpi inhibiitorite põlvkonda (ARC-II ja ARC-III). Seejuures oli ARC-II kõige efektiivsema esindaja (ARC-903) IC50 väärtus PKAc inhibeerimiskatsetes 5,3 nM ning ARC-III kõige efektiivsema esindaja (ARC-1028) IC50 väärtus väljatõrjumiskatsetes PKAc-ga alla 0,5 nM. Järgmise sammuna määrati ARC-II ja ARC-III kõige efektiivsemate ühendite selektiivsusprofiilid; ühendid osutusid rühm-selektiivseteks inhibiitoriteks mitmete basofiilsete proteiinkinaaside, eriti AGC-rühma esindajate suhtes. Edasistes uuringutes tehti kindlaks, et tulenevalt uute ARC-de suhteliselt laiast selektiivsusprofiilist oli võimalik rakendada ARC-del põhinevat sidumismeetodit (FA-meetod) kinaasiaktiivsuse hindamiseks ning proteiinkinaasi-inhibiitorite iseloomustamiseks mitte ainult eelnevalt mudelkinaasina kasutatud PKA jaoks, vaid ka viimasega struktuurselt sarnase PKGI jaoks. Töö viimases etapis demonstreeriti, et uute ARC-de rakendusala ei piirdu biokeemiliste mõõtmismeetoditega, vaid see on laiendatav in vitro katsetele elusrakkudes ja –kudedes. ARC-II ja ARC-III efektiivsemate esindajate proteolüütiline stabiilsus ja võime läbida raku plasmamembraani võimaldasid uurida uusi inhibiitoreid roti isoleeritud ajuarterite silelihaskoes. Nende katsetuste tulemusena selgus, et ARC-d suudavad inhibeerida cAMP/PKA ja cGMP/PKG radu füsioloogilistes tingimustes.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Proteiinkinaaside spottimine pinnale ja kvantifitseerimine ARC-tüüpi sondiga
(Tartu Ülikool, 2017) Pupart, Hegne; Ivan, Taavi; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Keemia instituut
Töö eesmärgiks oli uurida ARC-tüüpi sondiga proteiinkinaasi (PK) aktiivse hulga määramise võimalikkust proovi pinnale adsorbeerimise kaudu. Optimaalsete tingimuste leidmiseks uuriti muuhulgas erinevate pindade sidumismahtu, lahuse komponentide ja inkubeerimisaja pikkuse mõju katseetappides. Meetodit katsetati kolme erineva kinaasiga: PKAc, ROCK2 ning MSK1. Tutvustatav meetod on lihtsa teostatavusega ja võimaldab tuvastada aktiivse kinaasi hulka pikomoolides. Kuigi ARC-sondi põhise tuvastusmeetodiga, esinesid võrdlemisi suured erinevused paralleelkatsetes. Leiti, et adsorbeerunud aktiivse PK analüüsimine on võimalik. Meetodit saab rakendada erinevate PK-de puhul paralleelselt ja töö käigus selgunud tingimuste mõju annab olulist teavet meetodi edasiarendamiseks.