Sirvi Märksõna "biokeemia" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 20 21

listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Adruga - Fucus vesiculosus'ega - väetatud põldudel kasvanud tera-, juur- ja puuviljade joodisisaldavus Vilsandi saarel : (kokkuvõte Tartu Ülikooli arstiteaduskonna poolt 1. dets. 1929 auhinnatud tööst)
(1930) Siim, August
listelement.badge.access-status Embargo ,
Avatud lähtekoodiga Trapjaw platvormi prototüüp mikroskoobi katteklaaside valmistamiseks üksikmolekul fluorestsents mikroskoopia jaoks
(Tartu Ülikool, 2024) Aljand Argo; Laasfeld, Tõnis, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Tehnoloogiainstituut
Bakalaurusetöö eesmärgiks on luua kvaliteetne kuid lihtsalt ehitatav, kasutatav ja odav robootikasüsteem ning vastav prototüüp katteklaaside pesemiseks, mis muudaks tootmisprotsessi lihtsamaks, standardiseeritumaks ja skaleeritavamaks. Prototüübi loomisel rakendatud avatud riistvara põhimõte võimaldab ka teistel laboritel sama süsteemi ehitada ja rakendada. Täieliku sisepeegelduse fluorestsentsmikroskoopia on populaarsust kogunud tänu võimekusele teostada üksikmolekuli tundlikusega mõõtmisi, võimaldades uurida proovi populatsiooni üksikmolekuli tasemel, samas kui paljude klassikaliste analüütilise keemia meetodite mõõtmispiir algab miljonite või triljonite molekulide juures. Antud metoodikal on aga erilised nõuded elektroonika, optika, mehaanika ning ka proovi omaduste osas. Üks nõue proovile on segavate faktorite, näiteks mittespetsiifilise sidumise ja autofluorestsentsi madal tase. Viimast on võimalik saavutada pegüleeritud katteklaasidega, kuid kommertsiaalselt kättesaadav katteklaasid ei ole sobiva kvaliteediga ehk neid on vajalik toota kohapeal. TIRF mikroskoopia populaarsuse kasvuga ning katteklaaside tootmise keerukuse tõttu on tootmisprotsess muutunud pudelikaelaks, mida võiks lahendada odava ning lihstasti konstrueeritava vabavaralise katteklaase peseva robootikasüsteemiga.. Valiminud Trapjaw robootikasüsteemi prototüüpi on võimalik konstrueerida ka sügavama robootikataustata. Kasutusel on lihtsasti kättesaadavad elektroonikakomponendid nagu üldtuntud arendusplaat Arduino UNO. Samuti on enamus mehaanilistest komponentidest 3D prinditavad või kättesaadavad üldehituskauplustest. Töö käigus disainitav robootikasüsteem aitaks automatiseerida ning standardiseerida TIRF mikroskoopia katteklaaside tootmise protsessi.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Biochemistry of dopamine D2 receptors and its association with motivated behaviour
(2010-10-25) Herm, Laura
Dopamiinil ehk 3-hüdroksütüramiinil on ajus väga keskne roll motiveeritud ning hüvekäitumise vahendamisel ning arvatakse, et erinevused dopamiinergilises signaaliülekandes on üheks aluseks indiviididevahelistele erinevustele hüvititele tundlikkuses ning motiveeritud käitumises üldiselt. Käesolevas töös kirjeldati roti aju striataalset dopamiinergilist signaaliülekannet läbi D2 retseptorite, kasutades selleks [35S]GTPS sidumise aktivatsiooni analüüsi. Käitumuslikest hüve- ning motiveeritud käitumisega seotud mudelitest uuriti uudistamisaktiivsust, looduslikku tüüpi sarrusti (suhkrulahus) manustamiskäitumist, passiivset hüve vastuvõttu (kõdistamise näol) ning stressiga (mis on kui midagi vastupidist hüvitile) toimetulekut. Selgus, et vähe- ning palju-uudistavate (vastavalt LE ja HE) loomade D2 retseptori signaaliülekande tundlikkuses baastasemel muutust ei olnud, kuid mõjutades nende aju dopamiinergilist tasakaalu amfetamiiniga tekkisid ka erinevused: nimelt vähendas amfetamiin HE rottide D2 retseptorite signaaliülekande tundlikkust, mis oli kooskõlas ka nende käitumusliku desensitisatsiooniga. D2 retseptori signaaliülekande tundlikkus korreleerus hüviti aktiivse manustamisega (suhkrulahus), kuid kui hüvitit manustati passiivselt (kõdistamine), ei ilmnenud erinevusi kõditamisele rohkem või vähem reageerivate rottide vahel. Seega võib järeldada, et D2 retseptor vahendab ehk rohkem motiveeritud käitumise motoorseid kui subjektiivseid aspekte, erinevalt D1 retseptorist, mille signaaliülekande tundlikkust mõjutasid nii kõdistamine kui stress (mõlemad passiivselt vastuvõetavad). See omakorda tõstatab vajaduse alatüüp-spetsiifiliste ligandide järgi käitumiskatsetes, miska töö teises osas iseloomustati uusi potentsiaalselt selektiivseid norapomorfiinil põhinevaid D2 agoniste.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Biokeemia : [õpik]
(1973) Männik, August
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Biokeemia laboratoorsed tööd
(1971) Köstner, Ado, koostaja; Siimer, Enn, koostaja
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Development of protein kinase inhibitors based on adenosine analogue-oligoarginine conjugates
(2010-10-04) Lavõgina, Darja
Valkude fosforüleerimisreaktsioon elusorganismides ning seda katalüüsivad valgud – proteiinkinaasid – on olnud loodusteadlaste tähelepanu keskpunktis alates 1950-test aastatest, kui E. P. Kennedy, E. H. Fischeri, E. G. Krebsi, E. W. Sutherlandi ja W. D. Wosilaiti tööd avasid kinaaside ajastu [Cohen P., 2002]. Proteiinkinaasid osalevad enamikes raku elutegevuseks olulistes protsessides, seetõttu on häired nende ensüümide funktsioneerimises (eriti kõrgendatud aktiivsus) seotud mitmete haigustega (sealhulgas vähkkasvajad, diabeedid ja astma). Sellest tulenevalt keskenduvad nii akadee¬miliste teadlaste kui ka farmaatsiafirmade ravimiarendajate huvid üha enam kinaaside toimemehhanismide uurimisele ja võimaluste selgitamisele rakusiseste valkude fosforüleerimistasakaalude mõjutamiseks. Viimase ülesande lahendamisel on üheks perspektiivsemaks teeks proteiinkinaaside inhibiitorite arendus. Käesolev töö kirjeldab adenosiini analoogi ja arginiinirikka peptiidi konjugaatide (ARC-de) arendamist proteiinkinaaside bisubstraatseteks kõrge inhibeerimispotentsiaaliga ligandideks, nende inhibiitorite disaini ja sünteesi. Uudsete ARC-de arendamisel lähtuti tulemustest, mis saadi inhibiitorite struktuuri mõju uurimisel nende sidumis- või inhibeerimisomadustele toimes cAMP-sõltuva proteiinkinaasiga (PKA) ning sama proteiinkinaasi ARC-dega kooskristalliseerimisel saadud struktuuride röntgenanalüüsil. Töö tulemusena õnnestus valmistada kaks uut ARC-tüüpi inhibiitorite põlvkonda (ARC-II ja ARC-III). Seejuures oli ARC-II kõige efektiivsema esindaja (ARC-903) IC50 väärtus PKAc inhibeerimiskatsetes 5,3 nM ning ARC-III kõige efektiivsema esindaja (ARC-1028) IC50 väärtus väljatõrjumiskatsetes PKAc-ga alla 0,5 nM. Järgmise sammuna määrati ARC-II ja ARC-III kõige efektiivsemate ühendite selektiivsusprofiilid; ühendid osutusid rühm-selektiivseteks inhibiitoriteks mitmete basofiilsete proteiinkinaaside, eriti AGC-rühma esindajate suhtes. Edasistes uuringutes tehti kindlaks, et tulenevalt uute ARC-de suhteliselt laiast selektiivsusprofiilist oli võimalik rakendada ARC-del põhinevat sidumismeetodit (FA-meetod) kinaasiaktiivsuse hindamiseks ning proteiinkinaasi-inhibiitorite iseloomustamiseks mitte ainult eelnevalt mudelkinaasina kasutatud PKA jaoks, vaid ka viimasega struktuurselt sarnase PKGI jaoks. Töö viimases etapis demonstreeriti, et uute ARC-de rakendusala ei piirdu biokeemiliste mõõtmismeetoditega, vaid see on laiendatav in vitro katsetele elusrakkudes ja –kudedes. ARC-II ja ARC-III efektiivsemate esindajate proteolüütiline stabiilsus ja võime läbida raku plasmamembraani võimaldasid uurida uusi inhibiitoreid roti isoleeritud ajuarterite silelihaskoes. Nende katsetuste tulemusena selgus, et ARC-d suudavad inhibeerida cAMP/PKA ja cGMP/PKG radu füsioloogilistes tingimustes.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
I биохимическая конференция Прибалтииских республик и Белоруссии, посвященная 20-летию Латвийской, Литовской, Эстонской Советских Социалистических Республик, 15-19 сентября 1960 г. : [тезисы докладов]
(1960) Martinson, Eduard, toimetaja; Tähepõld, Lembit, toimetaja
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
I биохимическая конференция Прибалтийских республик и Белоруссии, посвященная 20-летию Латвийской, Литовской, Эстонской Советских Социалистических Республик, 15-19 сентября 1960 г. : программа
(1960) Anonymous
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Kaubatundmise biokeemilised alused
(1964) Rannak, Eero
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Martinson, Eduard. Isikuarhiiv
(Tartu, 2007) Tartu Ülikooli Raamatukogu; Martinson, Eduard, arhiivimoodustaja
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Meletemata quaedam de quaestione num salia alcalina albumen coagulatum et membranam mucosam solvere valeant : dissertatio inauguralis
(Dorpat : H. Laakmann, 1850) Pląskowski, Romuald
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Metoodilised juhendid bioloogilises keemias : arstiteaduskonna farmaatsia ja stomatoloogia osakonna üliõpilastele. 1
(Tartu Ülikool, 1989) Zilmer, Mihkel, koostaja
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Neutraalsoolade mõjust ultramaksimum-temperatuuri peale Tradescantia Zebrina juures
(1921) Kaho, Richard Hugo
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Processivity of cellulases and chitinases
(2017-02-14) Kurašin, Mihhail; Väljamäe, Priit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond.
Kahanevate naftavarude ja kasvava inimeste populatsiooni tõttu otsitakse võimalusi kasutada alternatiivseid energiaallikaid. Üheks võimaluseks on kasutada taastuva biokütuse ja tarbekaupade toorainena tselluloosi ja kitiini, mis on enim levinud biopolümeerid Maal. Lagundades tselluloos ja kitiin monomeerideks (vastavalt glükoosiks ja N-atsetüülglükoosamiiniks), on võimalik need edasi konverteerida bioetanooliks või kasutada neid oluliste kemikaalide sünteesiks. Looduses lagundatakse tselluloos ja kitiin ensüümide abil. Vastavalt viivad tselluloosi lagundamist läbi ensüümid, mida nimetakse tsellulaasideks ja kitiin degradeeritakse kitinaaside abil. Ensümaatilist hüdrolüüsi rakendatakse ka tööstuses, et vältida kontsentreeritud mineraalhapete ja kõrgemate temperatuuride kasutamist. Kahjuks on looduslikud ensüümid madala efektiivsusega, mistõttu ensüümide tootmisega seotud kulutused moodustavad suure osa kujunevast toodangu lõpphinnast. Ensüümide võimekust on aga võimalik parandada insenergeneetilise modifitseerimise teel. Kuid vaatamata sellele, et tsellulaase ja kitinaase uuritakse üle poole sajandi, on teadmised ensüümide toimimise molekulaarsetest mehhanismidest veel poolikud. Üheks oluliseks tsellulaaside ja kitinaaside kineetiliseks parameetriks on protsesiivsus, mis väljendub keskmise katalüüsi aktide arvuna, mille ensüüm sooritab enne substraadilt lahkumist. Tasub ka mainida, et peamiselt panustavad just protsessiivsed ensüümid tselluloosi/kitiini lagundamisele, mistõttu on nende toimemehhanismide väljaselgitamine kriitilise tähtsusega. Käesoleva töö eesmärk oli protsessivsete tsellulaaside ja kitinaaside biokeemiline kirjeldamine. Töö raames töötati välja uued meetodid protsessiivsuse ja teiste kineetiliste parameetrite mõõtmiseks. Eelnevalt oli teada, et individuaalse protsessiivse tsellulaasi hüdrolüüsi kiirust limiteerivaks faktoriks on ensüümi aeglane dissotsieerumine substraadilt. Antud töös aga selgus, et koostöös teiste tsellulaasidega on hüdrolüüsi kiirus piiratud ensüümi protsessiivse liikumise kiiruse poolt. Lisaks leidsime, et efektiivseks hüdrolüüsi toimumiseks on olulised tugevad ensüüm-substraat interaktsioonid ensüümi aktiivtsentri substraadi sidumiskohtades ja tugevad ensüüm-produkt interaktsioonid aktiivtsentri produkti sidumiskohtades. Ühe interaktsiooni kadumine viib hüdrolüüsi efektiivsuse järsule langusele.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Studies on the role of helix 69 of 23S rRNA in the factor-dependent stages of translation initiation, elongation, and termination
(2011-04-12) Kipper, Kalle
Käesoleva doktoritöö eesmärgiks oli selgitada i) ribosomaalse 23S rRNA heeliksi 69 võimalikku rolli valgusünteesi faktorkatalüüsitud etappides ning ii) heeliksis 69 sisalduvate pseudouridiinide rolli translatsiooni terminatsioonil. Lisaks on töös selgitatud ka pseudouridiini süntaasi RluD substraadispetsiifilisust määravaid tegureid. Doktoritöö alguseks oli kogunenud märkimisväärne hulk struktuuripõhiseid viiteid heeliksi 69 osaluses kohta erinevates ribosoomi töötsükli osades. Käesoleva doktoritöö eesmärgiks oligi nende struktuuripõhiste hüpoteeside biokeemiline kontrollimine. Töö eksperimentaalses osas asendati suunatud mutageneesi abil heeliksi 69 valitud positsioonides olevad natiivsed lämmastikalused teiste lämmastikalustega. Variantsed ribosoomid ekspresseeritid E.colis, affiinsuspuhastati ning nende ribosoomide aktiivsust analüüsiti erinevates in vitro katsesüsteemides. Katsetest saadud tulemused osutavad, et 23S rRNA heeliks 69 osaleb initsiatsioonifaktorite aktiivsuse regulatsioonis 70S initsiatsioonikompleksi moodustumisel ning et heeliks 69 on oluline ribosoomi üleminekul initsiatsioonifaasist protsessiivse elongatsiooni faasi. Pseudouridiinide eemaldamine heeliksist 69 pärssis peptiidi vabastamist polüpeptiidi vabanemisfaktori RF2 poolt, kuid ei mõjutanud RF2-ga struktuurilt väga sarnase vabanemisfaktori RF1 aktiivsust. See tulemus osutab erinevustele RF1 ja RF2 katalüüsimehhanismis. Lisaks osutavad meie tulemused, et pseudouridiini süntaasi RluD spetsiifikat heeliksi 69 suhtes suunab heeliksi 69 positsioonis 1916 asuv nukleotiid.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Ueber die Verbindungsweise der in den organischen Körpern enthaltenen Mineralbestandtheile
(1864) Neimandt, A.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Ühildatud GETM-ERGOM mudeli valideerimine soome lahe temperatuuri, nitraadi ja klorofülli põhjal aastate 1996-2005 kohta
(Tartu Ülikool, 2016) Treimann, Meri Liis; Maljutenko, Ilja, juhendaja; Ohvril, Hanno, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Füüsika instituut
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Üldine biokeemia. 1.
(Tartu Ülikool, 1993) Zilmer, Mihkel
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Изучение и применение лектинов. Т.1, Общие вопросы. Химия и биохимия лектинов : материалы I республиканской конференции посвященной 100-летию открытия первых лектинов, г. Тарту и г. Таллинн, 31 мая - 2 июня 1988 г.
(Tartu Riiklik Ülikool, 1989) Tartu Ülikool; Kisand, Kalle, toimetaja
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Труды I биохимической конференции Прибалтийских республик и Белоруссии, посвященной 20-летию Латвийской, Литовской, Эстонской Советских Социалистических республик, 15-19 сентября 1960 г.
(1961) Anonymous