Toitumise seosed lipoproteiinidega Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmestikus: korreleeritud andmete mitmemõõtmeline analüüs
Date
2013-06-06
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Antud bakalaureusetöös on Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmete põhjal vaadeldud võimalikke seoseid inimeste toitumisharjumuste ja metaboloomika-tunnuste vahel. Metaboliidid on metabolismi ehk ainevahetuse käigus tekkinud ühendid. Tavaliselt mõeldakse metaboliidi all madalmolekulaarseid ühendeid [1].
Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmebaasis on ligikaudu 10 000 geenidoonori kohta olemas detailsed metaboloomika-andmed, mille hulgas on üle 70 tunnuse, mis iseloomustavad eri tüüpi lipoproteiinide ja neis sisalduvate lipiidide kontsentratsiooni. Lisaks on teada andmed geenidoonorite toitumiseelistuste kohta ning doonorite sugu, vanus ja kehamassiindeks.
Töö esimeses peatükis on kirjeldatud kasutatavate andmete tausta ning on antud ülevaade olulisemate tunnuste jaotusest, kasutades graafilisi meetodeid. Teises peatükis on toodud ülevaade kasutatavast statistilisest meetodikast. Kolmandas ning neljandas peatükis rakendatakse metoodikat Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmetele.
Lipoproteiinide andmestiku dimensionaalsuse vähendamiseks rakendatakse andmetele esmalt peakomponentanalüüsi ning seejärel faktoranalüüsi. Samuti uuritakse toitumistunnuste seoseid nii üksikute lipoproteiinidega kui ka lipoproteiinide analüüsimisel saadud peakomponentide ja faktoritega. Lõpuks on katsetatud struktuurivõrrandite mudelite metoodikat, mis võimaldab ühe protseduuri käigus nii andmestiku dimensionaalsuse vähendamist kui ka seosestruktuuri uurimist.
Bakalaureusetöö kirjutamiseks on kasutatud tekstitöötlusprogrammi Microsoft Word 2010. Analüüsid on läbi viidud statistikapaketiga R. Joonised on tehtud programmidega Microsoft Excel 2010 ja Graphviz 2.30.1.