Conus consors’i konopeptiidide geene ümbritsevate kordusjärjestuste statistiline analüüs

Abstract

Mereteo Conus consors’i nagu paljude teiste mürgiste loomade toksiinigeene iseloomustab suur koopiate arv ja varieeruvus. Selle mitmekesisuse bioloogiline tekkemehhanism ei ole täpselt teada. Üheks suure varieeruvuse põhjuseks on arvatud lihtsate korduste esinemist geenide ümbruses. Käesoleva töö eesmärgiks on võrrelda lihtsate korduste esinemissagedust toksiini- ja teiste geenide (eksonite) ümbrustes. Lisaks testisime, kas leitud korduste pikkused on mõlemas valimis sarnased. Märgatavalt suurem korduste esinemistõenäosus või nende pikkuste oluline erinevus oleks potentsiaalseks kinnituseks hüpoteesile, et kordustel on oluline roll toksiinigeenide varieeruvuse tekitamisel. Bakalaureusetöö koosneb kahest peatükist. Esimene peatükk sisaldab uurimuse bioloogilise tausta ja terminite tutvustust, samuti töös kasutatud statistiliste testide ja suuruste teoreetiliste tagamaade kirjeldusi. Teine peatükk koosneb analüüsitava andmestiku kokkupanemise metoodika kirjeldusest, andmestiku kirjeldavast analüüsist ja tulemuste kokkuvõttest. Töö on kirjutatud Tartu Ülikooli Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Bioinformaatika õppetoolis. Töös kasutatud lähteandmed pärinevad Euroopa Liidu 6-nda raamprogrammi projektist CONCO – Cone Snail Genome Project for Health (LSHB-CT-2007/037592).