Haigustrajektooride sarnasuse hindamise metoodika
Date
2021
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Terviseandmete laialdane digitaliseerimine on avanud ukse personaalmeditsiini. Leides
sarnaste haigustrajektooridega patsiente, on võimalik ennustada tulevasi diagnoose,
haiguseid ennetada või nende mõjusid leevendada. Kuna bioinformaatikas leidub sarnase
ülesehitusega andmeid, kasutatakse antud töös ära sealt valdkonnast õpitut. Selleks
uuritakse töös meetodeid, mida kasutatakse bioinformaatikas sarnaste makromolekulide
leidmiseks. Käesoleva töö eesmärgiks on tuvastada parim meetod, et leida sarnaseid
haigustrajektoore kindla hulga patsientide seast. Selleks koostatakse meetodi katsetamiseks
skript, mis leiab generaatori poolt loodud patsientide diagnooside seast sarnaste
trajektooridega klastreid. Meetodi täpsuse kinnitamiseks kontrollitakse genereerimisel
kasutatud signaali olemasolu leitud trajektoorides. Uurimustöö lõpus kirjeldatakse parima
leitud meetodi töökäiku, analüüsitakse tulemusi ning tuuakse välja võimalikud viisid
edasiarenduseks.
Description
Keywords
dünaamiline programmeerimine, bioinformaatika, kliiniline trajektoor, pikim ühisjada