Süstik-vektorite tüübid
Kasutusel on palju erinevaid süstik-vektoried. Sõltuvalt geneetilistest elementidest, mida need plasmiidid sisaldavad, eristatakse nelja eri tüüpi süstik-vektoreid (vt. tabel 1):
- integreeritavad plasmiidid (YIp) - kasutades homoloogilist rekombinatsiooni võimaldavad need plasmiidid integreerida pärmigenoomi meid huvitavaid DNA järjestusi. Integratsioon toimub markergeeni lookusesse.
- autonoomselt replitseeruvad plasmiidid (YEp ja YRp) - kõrge koopia arvuga plasmiidid, mis sisaldavad järjestust, et tagada plasmiidi replikatsioon, säilivad rakus kui episoomid.
- tsentromeersed plasmiidid (YCp) - madala koopia arvuga plasmiidid; sisaldavad järjestust, mis tagab nende plasmiidide stabiilse pärandumise.
- ekspressiooniplasmiidid (YXp) - sisaldavad promootor- ja terminaatorjärjestusi, mis võimaldavad meid huvitava geeni ekpressiooni.
Tabel 1. Erinevates süstik-vektorites kasutatavad komponendid.
Plasmiid / element
|
|
YEp
|
YRp |
YCp |
YXp |
|
E. coli geenid ja DNA elemendid (ori, AmpR, MCS) |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
Pärmi geenid ja DNA elemendid |
markergeen (URA3, LEU2, TRP1 jne) |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
2 ![]() |
- |
+ |
- |
- |
- |
|
ARS element |
- |
- |
+ |
+ |
+ |
|
CEN element |
- |
- |
- |
+ |
+ |
|
promootor- ja terminaator- järjestused |
- |
- |
- |
- |
+ |
|
Pärandumise stabiilsus |
++ |
+ |
+/- |
+ |
+ |