Sirvi Autor "Lipu, Anita" järgi

Tulemuste filtreerimiseks trükkige paar esimest tähte
Nüüd näidatakse 1 - 2 2
  • Pisipilt
    listelement.badge.dso-type Kirje ,
    Profaagide mõju Pseudomonas putida faagiresistentsusele
    (Tartu Ülikool, 2023) Lipu, Anita; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Pseudomonas putida on molekulaar- ja mikrobioloogilistes uuringutes laialdaselt kasutatav mudelorganism, kuid üllatuslikult pole peaaegu üldse andmeid tema faagiresistentsusest. Töö eesmärgiks oli teada saada, kas P. putida genoomis leiduvad profaagid mõjutavad bakteri faagiresistentsust ning kui jah, siis millised profaagide geenid selle eest vastutavad. P. putida genoomis on neli profaagi, mille mõju faagiresistentsusele testisin erinevate deletsioontüvede abil. Tulemused näitasid, et profaagid suurendavad P. putida faagiresistentsust, kuid kaitse määr erinevate faagide vastu on erinev. Lähemalt uurisin profaage P1 ja P3, püüdes leida nende genoomidest faagiresistentsust suurendavaid lookusi. Katsetulemuste kohaselt paiknevad profaag P1 kaitseefekti eest vastutavad geenid regioonis PP_3897-3898-5643-5644 ning profaag P3 kaitseefekti eest vastutavad geenid regioonis PP_2292-2297.
  • Pisipilt
    listelement.badge.dso-type Kirje ,
    Pseudomonas putida profaag 3 kodeerib kahte faagikaitse süsteemi
    (Tartu Ülikool, 2025) Lipu, Anita; Hõrak, Rita, juhendaja; Ainelo, Andres, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Pseudomonas putida on gramnegatiivne mullabakter, mida kasutatakse laialdaselt näiteks bioremediatsioonis ja biotehnoloogias. Bakteri efektiivseks kasutamiseks on oluline, et see oleks resistentne faaginakkustele. Kuigi on teada, et profaagid kaitsevad oma peremeesbakterit sekundaarse faaginakkuse eest, ei ole P. putida profaagide kodeeritud kaitsemehhanisme sügavalt uuritud. Antud töös soovisin leida geene, mis vastutavad P. putida kolmandast profaagist sõltuva faagikaitse eest ja selgitada nende toimemehhanismi. Katsed erinevate P. putida deletsioontüvedega näitasid, et P. putida profaag 3 kodeerib kahte erinevat ühest geenist koosnevat faagikaitsemehhanismi: PP_5516 ja PP_2277.