Profaagide mõju Pseudomonas putida faagiresistentsusele
Date
2023
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Pseudomonas putida on molekulaar- ja mikrobioloogilistes uuringutes laialdaselt kasutatav
mudelorganism, kuid üllatuslikult pole peaaegu üldse andmeid tema faagiresistentsusest. Töö
eesmärgiks oli teada saada, kas P. putida genoomis leiduvad profaagid mõjutavad bakteri
faagiresistentsust ning kui jah, siis millised profaagide geenid selle eest vastutavad. P. putida
genoomis on neli profaagi, mille mõju faagiresistentsusele testisin erinevate deletsioontüvede
abil. Tulemused näitasid, et profaagid suurendavad P. putida faagiresistentsust, kuid kaitse
määr erinevate faagide vastu on erinev. Lähemalt uurisin profaage P1 ja P3, püüdes leida
nende genoomidest faagiresistentsust suurendavaid lookusi. Katsetulemuste kohaselt
paiknevad profaag P1 kaitseefekti eest vastutavad geenid regioonis PP_3897-3898-5643-5644
ning profaag P3 kaitseefekti eest vastutavad geenid regioonis PP_2292-2297.
Description
Keywords
Pseudomonas putida, profaag, faagiresistentsus