Sirvi Autor "Lopp, Lea" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 2 2

Mullabakter Pseudomonas putida fluoriiditolerantsust mõjutavad mehhanismid
(Tartu Ülikool, 2022) Lopp, Lea; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Fluor on leviku poolest 13 element maakoores. Fluori ühendit NaF lisatakse hambapastadele ja mõnel pool maailmas ka joogiveele, kuna fluoriidil on kaariest ennetav toime. Juba mõne millimolaarne fluoriidi kontsentratsioon mõjub bakterite kasvule pärssivalt, samas puutuvad bakterid eri keskkondades kokku kõrgete fluori ühendite kontsentratsioonidega. Mehhanismidest, kuidas bakterid fluoriidi taluda suudavad, on vähe teada. Mullabakter Pseudomonas putida-l on fluoriidiga toimetulekuks fluoriidioonide transporter CrcB. Varasemalt on meie laboris näidatud, et P. putida tüves, kus puudub CrcB transporter, tekivad spontaansed fluoriidi taluvad mutandid, mis näitab, et lisaks CrcB transporterile leidub veel mehhanisme, mis P. putida-l fluoriidi taluda võimaldavad. Käesolevas töös uuriti P. putida fluoriiditolerantsust mõjutavaid mehhanisme, mis esinevad bakteris lisaks CrcB transporterile ning kirjeldati katsete käigus leitud transkriptsiooniregulaatori mõju P. putida fluoriiditolerantsusele.
SOS-vastuse osalus mutantide tekkesageduses Pseudomonas putida pseudouridiini süntaaside truA ja rluA defektsetes tüvedes
(Tartu Ülikool, 2019) Lopp, Lea; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Modifikatsioonid tRNA-s võivad mõjutada translatsiooni täpsust. Pseudouridiinid on ühed enim levinud modifikatsioonid RNA-s. Valesti transleeritud valgud võivad aktiveerida SOS-vastuse, kuna vigade tekkimine translatsioonil on juhuslik, võivad tekkida vead ka DNA replikatsiooni ja parandamisega seotud valkudesse, mille funktsiooni häirumise tulemusena võib tekkida üheahelalist DNA-d või jäävad replikatsiooni käigus DNA-sse tekkinud vead parandamata. TruA ja RluA on pseudouridiini süntaasid, mis sünteesivad pseudouridiini tRNA-sse, antikoodoni lähedusse. Varasemalt on meie laboris näidatud mutatsioonisageduse suurenemist Pseudomonas putida tüvedes, kus on puudu TruA ja RluA. Käesolevas töös uurisin kas truA ja rluA geeni puudumine põhjustab P. putida rakkudes SOS vastust, mis omakorda võiks olla suurenenud mutantide tekkesageduse põhjuseks