Sirvi Autor "Naumova, Valeria" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 2 2

Inimese NAT10 geeni väljalülitamine CRISPR-Cas9 meetodil ja väljalülituse funktsionaalne valideerimine
(Tartu Ülikool, 2023) Naumova, Valeria; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
RNA modifikatsioonid on laialdaselt levinud eri tüüpi RNA-des: informatsiooni-RNA-des (mRNA), transpordi-RNA-des (tRNA) ja ribosomaalsetes-RNA-des (rRNA). Üks oluline RNA modifikatsioon on N4-atsetüültsütidiin (ac4C), mille puhul modifitseeritakse lämmastikaluse tsütosiini. ac4C modifikatsioon on katalüüsitud N-atsetüültransferaas 10 (NAT10) poolt, mille puhul arvatakse, et see ensüüm on ainus ac4C modifikatsiooni allikas inimese rakkudes. Käesoleva bakalaureusetöö eesmärk on lülitada välja (knockout – KO) NAT10 geen inimese embrüonaalsetes neeru rakkudes (HEK293F) kasutades CRISPR-Cas9 mehhanismi. CRISPR-Cas9 on väga laialdaselt kasutatav tööriist genoomi modifitseerimiseks ning geenide funktsiooni uurimiseks. Käesoleva bakalaureusetöö tulemusena saadi rakuliinid, kus oli vähenenud NAT10 mRNA suhteline ekspressioon, NAT10 valgu ekspressioon ja võimekus katalüüsida ac4C RNA modifikatsiooni, ning rakuliinide enamus kloonide puhul oli NAT10 geeni väljalülitamine osaline.
RNA modifikatsiooni ac4C roll inimese epidermaalsete keratinotsüütide rakulises vastuses
(Tartu Ülikool, 2025) Naumova, Valeria; Kudrin, Pavel, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
RNA reguleerib raku funktsioone ja geneetilise info ülekannet, kusjuures RNA keemilised modifikatsioonid, nagu N4-atsetüültsütidiin (ac4C), mille katalüüsijaks on ensüüm NAT10, mõjutavad oluliselt erinevaid rakulisi protsesse. ac4C on seotud translatsiooni, proliferatsiooni ja põletikuvastase regulatsiooniga. Psoriaas on krooniline põletikuline nahahaigus, mille patogeneesis osalevad aktiivselt epidermaalsed keratinotsüüdid ning põletikulised signaalirajad nagu NF-κB ja JAK-STAT. Käesoleva magistritöö eesmärk oli uurida RNA modifikatsiooni ac4C ja selle ainsa teadaoleva ensüümi NAT10 võimalikku rolli inimese epidermaalsete keratinotsüütide (NHEK) põletikulistes protsessides, keskendudes eelkõige psoriaasi arengule. Magistritöö tulemused näitasid, et psoriaasi korral on NAT10 ekspressioon suurenenud ja selle vaigistamine mõjutab JAK-STAT ja NF-κB signaaliradasid ning vähendab rakkude jagunemise ja keratinotsüütide proliferatsiooniga seotud geenide ekspressiooni.