Sirvi Autor "Pook, Martin, juhendaja" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 5 5

Inimese embrüonaalsete tüvirakkude transfekteerimine siRNA-ga kasutades rakku sisenevat peptiidi PepFect 14
(Tartu Ülikool, 2018) Ervin, Egle-Helene; Pook, Martin, juhendaja; Teino, Indrek, juhendaja; Maimets, Toivo, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Inimese embrüonaalsete tüvirakkude (hES rakud, ingl k human embryonic stem cells) potentsiaali rakendamine teaduses ja meditsiinis on osaliselt raskendatud seetõttu, et puudub efektiivne transfektsioonimeetod, mis ei mõjuks rakkude elulemusele ega pluripotentsusele. Käesolevas töös loodi uudne metoodika hES rakkude transfekteerimiseks siRNA-ga kasutades rakku sisenevat peptiidi PepFect 14 (PF14). Meetodi sobivuse ja spetsiifilisuse testimiseks kasutati sihtmärkidena pluripotentsusfaktorit OCT4 ning rakumembraanil paiknevat b-2-mikroglobuliini (B2M). Seejuures näidati, et PF14 vahendusel on võimalik vaigistada OCT4 ekspressioon vähemalt 70% rakkudest ja indutseerida mRNA taseme 10-kordne vähenemine. Lisaks selgus, et siRNA/PF14 kompleksid sobivad ka B2M ekspressiooni vaigistamiseks. Antud meetodi rakendatavust hES rakkudega seotud uuringutes kinnitab töös tuvastatud neuroektodermaalne diferentseerumine OCT4-siRNA transfektsiooni järgselt ning B2M ekspressiooni vähenemine antud diferentseerumise varajastel etappidel.
Pluripotentsusega seotud markervalkude ekspressioon inimese kolorektaalse adenokartsinoomi Caco2 rakkudes
(Tartu Ülikool, 2018) Kuus, Kaisa; Pook, Martin, juhendaja; Õunapuu, Ljudmila, juhendaja; Klepinin, Aleksandr, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Inimese kolorektaalse kasvaja rakkudes on eelnevalt kirjeldatud pluripotentsusega seotud transkriptsioonifaktorite markervalkude ekspressiooni RNA tasemel kuid tihti pole täpsemalt välja selgitatud spetsiifiliste transkripti vormide esinemist ja pole teada ka antud valkude ekspressioon. Antud magistritöö raames kirjeldati peamiste pluriotentsusega seotud markervalkude ekspressiooni Caco2 rakkudes ning tuvastati nende muutused rakkude diferentseerumisel buüraadiga. Leiti, et Caco2 rakud ekspresseerivad OCT4B transkripti, kuid butüraadiga diferentseerumisel seda enam ei detekteeritud. OCT4B1 transkript tuvastati vaid butüraadiga mõjutamise korral kuid selle tulemuse kinntamiseks on vaja teha rohkem korduskatsid. OCT4A transkripti ja valku Caco2 rakkudes ei esinenud. Olenemata butüraadiga mõjutamisest esines Caco2 rakkudes NANOG2 transkript ja NANOG2 valk, kuid NANOG1 puudus. Selgus, et SSEA4 ekpressioon suureneb ja SOX2 ekpressioon väheneb butüraadiga mõjutamise korral ning SSEA3 on ekspresseeritud vaid väga vähestes Caco2 rakkudes.
Rakku sisenevate peptiidide rakendatavus miRNA transpordiks inimese embrüonaalsetesse tüvirakkudesse
(Tartu Ülikool, 2014-06-17) Kasuk, Valmar; Pook, Martin, juhendaja; Lubenets, Dmitri, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Staphylococcus aureus TSLP ekspressiooni indutseerijana inimese primaarsete keratinotsüütide koekultuuris
(Tartu Ülikool, 2024) Peters, Mart Ole; Pook, Martin, juhendaja; Org, Tõnis, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Atopiline dermatiit (AD) on naha haigus, mis on iseloomustatud põletikuga, tugeva sügelusega ja nahabarjääri kahjustustega. Staphylococcus aureus on sageli AD patsientidel naha peal leitav pa togeen ja on üks AD sümptomite ägenemise põhjus. Lipoteikoonhape (LTA) on bakteri S. aureuse rakukesta komponent. Tüümuse stromaalne lümfopoetiin (TSLP) on AD patsientide kahjustatud nahas kõrgelt ekspresseeritud tsütokiin ja on AD raskusastme oluline tegur. Selleks, et paremini mõista, kuidas S. aureus mõjutab TSLP regulatsiooni analüüsiti käesolevas bakalaureusetöös pika ja lühikese TSLP transkritpi ekspressiooni koekultuuris kasvatatud inimese primaarsetes kerati notsüütides, mida mõjutati kuumtöödeldud S. aureusega, kuumtöödeldud S. epidermidisega ja S. aureuse LTAga. Keratinotsüütide kasvatamine ja töötlemine viidi läbi võrdlevalt kahes erinevas söötmesüsteemis.
TSLP transkriptide ekspressiooni indutseerimine ja tuvastamine inimese primaarsete keratinotsüütide koekultuuris
(Tartu Ülikool, 2022) Gutman, Georg-Kennet; Pook, Martin, juhendaja; Jürgenstein, Karl, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Atoopiline dermatiit (AD) on krooniline põletikuline nahahaigus, mida iseloomustab krooniline Th2 tüüpi põletikuseisund. Tüümuse stromaalne lümfopoetiin (TSLP) on tsütokiin, mis on kõrgelt ekspresseeritud AD patsientide keratinotsüütides ja on oluline Th2 tüüpi põletikuvastuse indutseerija. TSLP ekspressiooni reguleerimine võib osutuda allergiliste põletikuliste haiguste nagu astma ja AD ravis oluliseks sihtmärgiks. Antud bakalaureusetöö eesmärgiks oli võrrelda TSLP transkriptide ekspressiooni tolmulesta ekstrakti, ADga seotud tsütokiinide (IL-4, IL-13, TNFα), dsRNA viiruste analoogi (poly I:C) ja vitamiin D analoogi (kaltsipotriooli) poolt esile kutsutud rakuvastustes ning hinnata kaltsipotriooli eeltöötluse mõju poly I:C põhjustatud rakuvastuse tekkel. Käesoleva bakalaureusetöö tulemusena selgus, et kaltsipotriooli eeltöötlus võib moduleerida TSLP pika isovormi ekspressiooni ja takistada vastava valgu tootmist