Sirvi Autor "Pulk, Arto, juhendaja" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 2 2

G3BP2 valgusünteesi reguleeriv mõju IFITM1 mRNA-le
(Tartu Ülikool, 2022) Lass, Minna-Maria; Pulk, Arto, juhendaja; Mansour, Abbas, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Bakalaureuse töö eesmärgiks oli hinnata RNA-seonduvate valkude (G3BP2 ja Caprin-1) mõju valgusünteesile kasutades selleks rakuvaba HEK293FT in vitro translatsioonisüsteemi, mis oli kodeeritud reporter IFITM1 mRNA-ga. Tulemustest selgus, et G3BP2 valgul on IFITM1 reportervalgule vähene positiivne mõju valgusünteesile. Sama leiti, et Caprin-1 ja G3BP2 koostoimel on tugev ~ 16 kordne inhibeeriv mõju IFTIM1 translatsioonile. Tulemused viitavad, et G3BP2 ja Caprin-1 mõjutavad IFITM1 mRNA valgusünteesi.,
Rakuvaba valgusünteesi rakendamine inimese neuroblastoomi SH-SY5Y rakuliinis
(Tartu Ülikool, 2021) Liiv, Annika; Pulk, Arto, juhendaja; Kipper, Kalle, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Bakalaureuse töö eesmärk oli luua inimese neuroblastoomi rakuliini SH-SY5Y kasutades mudelsüsteem erinevate RNA-d siduvate valkude ja komplekside uurimiseks, et neid oleks võimalik välja puhastada ja kasutada struktuuribioloogilistes uuringutes. Töö käigus töötati välja metoodika SH-SY5Y rakuliinist translatsiooniekstrakti eraldamiseks ning ekstrakte kasutades leiti in vitro valgusünteesiks K + , Mg2+ ja mRNA optimaalsed tingimused. Tulemustest selgus, et G3BP-2 seostus mRNA külge ja ei oma endonukleaasset aktiivsust. Valgud G3BP-2 ja Caprin-1 langetasid koosmõjul valgusünteesi aktiivsust rohkem kui ainult G3BP-2-te kasutades, seejuures Caprin-1 valgusünteesile märgatavat mõju ei avaldanud. Western Blot meetod näitas, et translatsiooniekstraktile lisatud G3BP-2 ja Caprin-1 olid üleesindatud 40S subühikuid sisaldavas fraktsioonis.