Browsing by Author "Zhytnik, Lidiia"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 5 of 5
  • Thumbnail Image
    Item
    De novo and inherited pathogenic variants in collagen-related osteogenesis imperfecta
    (Wiley Periodicals, Inc., 2019) Zhytnik, Lidiia; Maasalu, Katre; Duy, Ho Binh; Pashenko, Andrey; Khmyzov, Sergey; Reimann, Ene; Prans, Ele; Kõks, Sulev; Märtson, Aare
    Background: Osteogenesis imperfecta (OI) is a rare genetic bone fragility disorder. In the current study, differences between the genotypes and phenotypes of de novo and inherited collagen‐related OI were investigated. Methods: A comparative analysis was performed of the genotypes and phenotypes of 146 unrelated inherited and de novo collagen I OI cases from Estonia, Ukraine, and Vietnam. Mutational analysis of the subjects and all available parents were per formed with Sanger sequencing. Results: Results showed that 56.16% of the OI cases were caused by de novo patho genic variants. The proportion of OI types OI1, OI4, and OI3 among subjects with inherited OI was 45.31%, 46.88%, and 7.81%, respectively. Among subjects with de novo OI, the proportions of OI types (OI1, OI4, and OI3) were almost equal. Both inherited and de novo OI pathogenic variants occurred more often in the COL1A1 gene than in the COL1A2. The majority of de novo cases were missense pathogenic variants, whereas inherited OI was mostly caused by loss of function pathogenic variants. Conclusion: In summary, there were significant differences between the phenotypes and genotypes of subjects with de novo and inherited OI. These findings may pro mote the further understanding of OI etiology, and assist with diagnostics proce dures, as well as with family plannin
  • Thumbnail Image
    Item
  • Thumbnail Image
    Item
    Eesti ja Vietnami Osteogenesis Imperfecta patsientide COL1A1 ja COL1A2 geenide mutatsioonianalüüs
    (Tartu Ülikool, 2016) Kändla, Ivo; Zhytnik, Lidiia; Raid, Raivo; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Antud magistritöö peamine eesmärk on tuvastada OI mutatsioone Eesti ja Vietnami päritolu patsientide COL1A1/2 geenides. Vietnami populatsioonis oli 59% ja Eesti 88% patsiente COL1A1/2 gmutatsioonidega. Kõige sagedasemad mutatsioonide tekkemehhanismid oli Eesti OI populatsioonis splaiss-saitide muteerumine ja Vietnami OI populatsioonis missenss-mutatsioonid.
  • Thumbnail Image
    Item
    Inter- and intrafamilial diversity based on genotype and phenotype correlations of Osteogenesis Imperfecta
    (2019-09-16) Zhytnik, Lidiia; Maasalu, Katre, juhendaja; Märtson, Aare, juhendaja; Kõks, Sulev, juhendaja; Tartu Ülikool. Meditsiiniteaduste valdkond
    Osteogenesis Imperfecta (OI) on haruldane geneetiline haigus, mis on tuntud ka kui “habraste luude haigus”. Patsientide fenotüübid varieeruvad kergest osteopeeniast kuni raskete või isegi letaalsete juhtudeni. Umbes 90% juhtumitest on haiguse peamiseks sihtmärgiks I tüüpi kollageen. Käesoleva doktoritöö eesmärgiks oli tuvastada genotüüpide-fenotüüpide korrelatsioone OI perekondades perekonnasisese ja -vahelise varieeruvusega. Me uurisime OI patsientide kliinilisi tunnused ja kollageeni patogensete variantide spektrit. Analüüsisime de novo kollageeni-OI juhtumeid ja genotüübi-fenotüübi korrelatsioone Eesti, Ukraina ja Vietnami OI patsientidel. Lisaks viisime läbi mittekollageeni-OI patsientide geneetilise sõeluuringu harvaesineva OI vormi (tüüp V) tuvastamiseks. Lõppeesmärgi saavutamiseks analüüsisime perekondade siseseid ja perekondade vahelisi varieeruvusi kollageeni patogensete variantidega OI perekondades. Eestis tuvastasime 90%-l OI patsientidest I tüüpi kollageeni patogensed variantid. Enamus neist põhjustasid kollageeni kvantitatiivse defekti. Ukraina OI patsientidest 64% kandsid I tüüpi kollageeni patogense variandi ja nende hulgas oli kvalitatiivsete ja kvantitatiivsete kollageeni defektide arv peaaegu võrdne. Pooled tuvastatud OI patogensetest variantidest olid varem kirjanduses kirjeldamata. Samuti ei olnud 57%-l patsientidel varasemat OI esinemist perekonnas teada ja haigus ilmnes de novo. Tuvastasime viis perekonda, kellel esineb tüüpi V OI, kuid esinesid varieeruvad fenotüübid, mis mitmel juhul sarnanesid klassikalise kollageen-OI fenotüüpidega. Perekondade sisene ja vaheline varieeruvus korreleerus kollageeni defekti tüübi ja geeniga. Kvalitatiivse kollageeni defektiga patsientidel oli suurem fenotüübiline varieeruvus võrreldes nendega, kellel esines kvantitatiivne kollageeni defekt. Doktoritöö tulemused laiendavad arusaamist Osteogenesis Imperfecta geneetikast, etioloogiast, patogeneesist ja “haprade luude” fenotüübi seostest. Käesolev uuring aitab kaasa OI diagnoosimisele ja edasistele OI-uuringutele, mille eesmärk on parandada OI patsientide elukvaliteeti.
  • Thumbnail Image
    Item
    Osteogenesis Imperfecta geneetiline eelsoodumus: eksoomi analüüs Eesti perekondades
    (Tartu Ülikool, 2014-06-17) Zhytnik, Lidiia; Maasalu, Katre, juhendaja; Nikopensius, Tiit, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut