Sirvi Kuupäev , alustades "2013-06-27" järgi

Filtreeri tulemusi aasta või kuu järgi

Nüüd näidatakse 1 - 5 5

Substrate specificity of the multisite specific pseudouridine synthase RluD
(2013-06-27) Leppik, Margus
Iga raku elutegevuse üks olulisemaid protsesse on valgusüntees, mille käigus mRNA nukleotiidse järjestuse järgi sünteesitakse vastavalt geneetilisele koodile valgud. Valgusünteesi eest vastutab valkudest ja RNA-st (rRNA) koosnev kompleks, ribosoom, mis koosneb kahest ebavõrdse suurusega osast (suurest ja väiksest subühikust). Väiksem subühik vastutab geneetilise koodi järgimise ja suurem valkude valmimise eest. Ribosoom koosneb RNA-st (rRNA) ja valkudest (r-valk). rRNA on ribosoomi funktsioneerimise jaoks kõige olulisem komponent. Lisaks konserveerunud struktuurile sisaldab rRNA ka mitmeid mittestandardseid nukleotiide, mille paiknemine on olnud teada juba mõnda aega, kuid nende rolli kohta ribosoomides on endiselt väga vähe andmeid. Pseudouridiinid on enim levinud RNA modifikatsioonid ja nende tekkimise eest vastutavad valgud – pseudouridiini süntaasid. RluD on pseuouridiini süntaas, mis koosneb kahest osast: S4-sarnasest ja katalüütilisest osast. RluD põhjustab RNA-s pseudouridiinide tekkimise kolme kohta, millest kõik on väga kõrgelt konserveerunud ja asuvad suure subühiku rRNA heeliksis 69 (H69). Vaatamata tähtsusele, ei ole senini teada, kuidas tunneb RluD ära just need uridiinid, mida ta muudab. Käesolevas töös kasutasime geneetilisi meetodeid, et tekitada mutatsioone rRNA ja RluD geenide kindlatesse kohtadesse, tuvastamaks kuidas need mutatsioonid muudavad RluD poolt sünteesitavate pseudouridiinide tekkimist. Uurimise käigus leidsime, et RluD on spetsiifiline vaid positsioonide 1911, 1915 ja 1917 suhtes kui rRNA on ribosoomide koosseisus, kuid kaotab olulisel määral oma spetsiifilisusest, kui rRNA ei ole r-valkudega seotud. RluD aktiivsuse jaoks on oluline kontakteerumine nukleotiidiga positsioonis 1916, mis on ainuke leitud spetsiifilisuse määraja rRNA-s. Saadud andmed annavad ka alust väita, et RluD seondumine rRNA-ga on kaheetapiline. S4-sarnane osa määrab ära selle piirkonna, kus asuvad modifitseeritavad nukleotiidid, ja katalüütiline osa määrab lõplikult spetsiifilisuse. Kõik RluD poolt tekitatavad pseudouridiinid tehakse rRNA-sse üheaegselt ja ilma kindla järjekorrata. Antud töös saadud tulemused aitavad paremini mõista protsesse, mis on vajalikud funtsionaalsete ribosoomide tekkimiseks rakkudes.
European legal and political mechanisms in promotion of freedom of expression in the norm-violating state: case of Russian Federation
(Tartu Ülikooli Euroopa kolledž, 2013-06-27) Chanadiri, Alexander; Mälksoo, Lauri, juhendaja; Kurs, Eveliis, juhendaja; Tartu Ülikool. Euroopa Kolledž
The purpose of this thesis is to explain the essence of European legal and political mechanisms in promotion of human rights, particularly freedom of expression in the Russian Federation. The confrontation between Europe and Russia over the practice of this commonly accepted liberal democratic norm has become vigorous since the adoption of ECHR in 1998 by the latter. This study emphasizes analysis of obligations taken by Russia under international law and European legal and political instruments for monitoring the compliance. Deriving from the theory of international socialization developed by Thomas Risse, Stephen Ropp and Kathryn Sikkink the research tries to contribute into the understanding of the process and applicability of the theory to powerful norm-violating state. This is done through consideration of the ECtHR case law and evaluation of international political pressure generated by transnational advocacy networks based on particular case studies.
Genetic susceptibility factors in endometriosis
(2013-06-27) Lamp, Merit
Endometrioos on sageli esinev krooniline günekoloogiline haigus, mille korral emaka limaskesta sarnane kude esineb kolletena väljaspool emakat, enamasti munasarjadel ja kõhuõõne seinal, harvem ka kuseteedes, sooleseinas jne. Antud kolletest menstruatsiooni ajal erituv veri põhjustab põletikulise reaktsiooni teket ning liidete moodustumist kõhuõõnes. Haigus võib kulgeda kaebusteta, kuid sageli põhjustab see tugevaid alakõhuvalusid ja viljatust, mõjutades seeläbi märkimisväärselt nii haigust põdevate naiste kui nende lähedaste elu. Kuna endometrioosi diagnoosimine põhineb kollete visualiseerimisel operatsiooni käigus, siis võib õige diagnoosini jõudmine hilineda aastaid. Endometrioos on kompleksne haigus, mille tekkepõhjused pole veel täielikult selged. Tõenäoliselt on haiguse kujunemises roll nii geneetilisel eelsoodumusel, immuunsüsteemi häiretel kui ka keskkonnafaktoritel. Endometrioosi riski mõjutavate geenide kindlaks tegemine annab teavet haiguse arengus osalevatest bioloogilistest mehhanismidest ning võimaldab välja töötada efektiivsemaid diagnoosimis- ja ravimeetodeid. Antud töö põhieesmärgiks oli uurida endometrioosi tekke seost erinevate kandidaatgeenidega. Selleks kasutati 199 tervelt ja 150 endometrioosi põdevalt naiselt kogutud DNA proove ning võrreldi erinevate geenivariantide esinemissagedust kahes grupis. Lisaks analüüsiti endometrioosikoes sünteesitava valgu surviviini vastaste autoantikehade esinemist 98 patsiendi ja 47 sarnaste kaebustega endometrioosi mittepõdeva naise seerumis, et selgitada, kas neid saab kasutada haiguse väheinvasiivse biomarkerina. Uuringu tulemused näitasid, et eelsoodumust endometrioosi tekkeks võivad mõjutada kümnest testitud geenist viis, mille poolt kodeeritavad valgud osalevad östrogeenide sünteesis (17β-hüdroksüsteroid dehüdrogenaas 1) ja toimes (östrogeeni retseptor β), koe remodelleerimises (maatriksi metalloproteinaasid 2 ja 9) ja veresoonte kasvus (vaskulaarne endoteliaalne kasvufaktor). Östrogeeni retseptor α kodeeriv geen on aga enam seotud naistel esineva viljatusega. Lisaks selgus, et uuritud antikehi ei saa kasutada endometrioosi diagnostilise markerina, kuna nende sisaldus haigete ja tervete naiste seerumis on sarnane. Antud töö andis uut teavet endometrioosi geneetilise tausta kohta, kuid haigusega seotud geenivariantide täpse toimemehhanismi väljaselgitamiseks on vajalikud edasised uuringud.
Ukraine's attitude towards European integration since the 2010 presidential elections: through the lenses of rationalism and constructivism
(Tartu Ülikooli Euroopa kolledž, 2013-06-27) Underwood, Mark; Nizhnikau, Ryhor, juhendaja; Tartu Ülikool. Euroopa Kolledž
This study focuses the issue of Ukraine‟s attitude towards European integration since the 2010 presidential elections. It looks at speeches and articles from Ukrainian officials about European integration. Using constructivism and rationalism as lenses, we are able better understand Ukraine's attitude towards European. The periods preceding the 2010 presidential elections have been studied by Kratochvil and Tulmets (2010) and state the period from 2006 – 2010 is a period of strongly rationalist modes of argumentation between EU and Ukraine. The research question is: how has Ukraine‟s behaviour concerning European Integration changed since the 2010 presidential elections? This study is important because the presidential elections in 2010 marked a change of president, government, as well as potential change in foreign policy in Ukraine. The first chapter gives an introduction and looks at the methodology used in the study. The second chapter looks at what literature is available on the topic of European integration and gives a brief overview of the European Union's attitude towards Ukrainian integration. It also looks at the theoretical framework the case study will use, which is an adaptation of Kratochvil and Tulmets' original study. The third chapter includes the case study which starts by giving a brief background to Kratochvil and Tulmets' findings and follows on with the post-presidential election analysis. Finally conclusions are drawn finding that Ukraine‟s attitude towards European integration has most stayed the same, with a focus on rationalist modes of argumentation. Similar to the before the elections, officials have also moved back to constructivist modes occasionally. The biggest change which was seen was Ukraine new ability to use Russia and the Customs Union as leverage, or as an alternative to EU integration, to European integration in an attempt to speed up the EU‟s integration with Ukraine.
Normative media indicators: content analysis of media sustainability Index reports on Russia from 2001 until 2012
(Tartu Ülikooli Euroopa kolledž, 2013-06-27) Arst, Ingvar; Pääbo, Heiko, juhendaja; Lõhmus, Maarja, juhendaja; Tartu Ülikool. Euroopa Kolledž
There are lots of methods and tools worldwide that are measuring and evaluating variety of fields and standings. The most prominent tool is an index that indicates or measures certain values, producing a discourse in a given field. This is a normative approach, establishing a standard by stating relating or deriving norm. The current thesis sets its focus on Media Sustainability Index (MSI) reports on Russia from 2001 until 2012. The aim of the thesis was to investigate how this particular index influences and controls the production of discourse in 21st century global world with specific focus on how human factor, panelists and moderators have an influence on the final outcomes. The research assumes that an index is a utility tool that enables to promote Western values and stabilize hegemony struggles. The research is following Post-Structuralism paradigm, therefore at first it is important to examine the object itself and then the systems of knowledge that produced the specific object. In order to examine the object and the knowledge of MSI reports on Russia, the research conducted content analysis with 215 markers that registered actors, actions, panelists, citations, highlights, contexts, tonality, and temporal spatial division. Findings from content analysis were divided among three modules that distinguish structural and contextual characteristics, which describe and interpret production and dynamics of MSI reports on Russia from 2001 until 2012. The third module focuses on the citations and highlights that are textual tools, which most clearly depict panelists and moderators input for the final outcome. The research is concluding that content and context of MSI reports promote Western values like rule of law and freedom of speech by the norm how it is perceived in the US.