Sirvi Märksõna "afiinsus" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 4 4

listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Anioonse fragmendi mõju proteiinkinaaside CK2 ja DYRK1A inhibiitorite afiinsusele
(Tartu Ülikool, 2018) Issajev, Artjom; Viht, Kaido, juhendaja; Uri,Asko, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Käesolevas töös iseloomustatakse CK2 bisubstraatsete inhibiitorite seondumisvõimet proteiinkinaasile DYRK1A. Võrreldi 16 inhibiitorit, mis erinesid üksteisest proteiinkinaasi ATP-taskusse suunatud struktuurielemendi ja sellega seotud anioonse fragmendi poolest. Töö tulemused näitasid, kuidas nimetatud struktuursed erisused muudavad inhibiitorite afiinsust ja selektiivsust CK2 ja DYRK1A suhtes. Lisaks avastati kõrgafiinne DYRK1A fluorestsentssond, mida saab kasutada uute DYRK1A inhibiitorite iseloomustamiseks.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
ARC-inhibitors: from reliable biochemical assays to regulators of physiology of cells
(2018-05-11) Rahnel, Hedi; Uri, Asko, juhendaja; Viht, Kaido, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond
Inimrakk on keeruline süsteem, mis koosneb paljudest molekulidest ning rangelt reguleeritud molekulidevahelisest kommunikatsioonist. Proteiinkinaasid on valgud, mis rakus olulisi protsesse kontrollivad. Häireid proteiinkinaaside töös on seostatud nt vähkkasvajate ja südameveresoonkonna haigustega. Üheks võimaluseks nende haigustega võidelda on piirata proteiinkinaaside liigset aktiivsust molekulidega, mida nimetatakse inhibiitoriteks. Selleks, et teha kindlaks, milline inhibiitor sobib proteiinkinaasi aktiivsuse reguleerimiseks rakkudes, tuleb inhibiitorite omadusi võrrelda. Antud doktoritöös optimeeriti kaks meetodit. Esimene võimaldab mõõta proteiinkinaasi ja inhibiitori omavahelist sobivust rakuvabas keskkonnas (katseklaasis). Arendatud meetod on võrreldes varasemate käsitlusviisidega märgatavalt tundlikum. Selleks, et rakku sisenenud inhibiitori koguse kohta aimu saada, töötati doktoritöö käigus välja kvantitatiivne meetod. Teades, kui palju inhibiitorimolekule on rakkudesse sisenenud, oli võimalik ennustada, kui võimekas inhibiitor rakkudes on. Järgmisena arendati kahele olulisele proteiinkinaasile inhibiitorid, mille omadusi hinnati muuhulgas ka rakendades eelmainitud meetodeid. Näidati, et arendatud inhibiitorid sisenesid edukalt rakkudesse, seostusid tugevasti sihtmärk-kinaasile ning mõjutasid nende aktiivsust. Võrreldes kommertsiaalselt saadavate inhibiitorite ning kliinilistes katsetustes olevate ühenditega, näitasid uued inhibiitorid rakkudes märgatavalt paremat tõhusust. Proteiinkinaaside aktiivsuse mõjutamine inhibiitoriga võimaldas selektiivselt tappa vähirakud jättes samadel tingimustel normaalsed rakud elujõuliseks. Katsed vereproovidega näitasid, et inhibiitorid aitasid efektiivselt vältida vereproovides agregaatide ehk trombi algete tekkimist. Doktoritöö tulemused toetavad uute meetodite kasutamist inhibiitorite analüüsimiseks ning uut tüüpi inhibiitorite edasi arendamist ravimiarenduses ning proteiinkinaaside rollide uurimises.
listelement.badge.access-status Embargo ,
Atsetüülkoliinesteraasi afiinsuskromatograafilise kandja süntees
(Tartu : Tartu Riiklik Ülikool, 1974) Lendla, Mari; Ilomets, Tullio, juhendaja
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
CK2 kinaasi lisataskusse seostuvate inhibiitorite süntees ja iseloomustamine
(Tartu Ülikool, 2025) Ivanov, Jaroslav; Enkvist, Erki, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Töö keskendus modifitseeritud ARC-tüüpi inhibiitorite sünteesile, mis seostuvad CK2 kinaasi lisataskuga. Sünteesiti kolm ühendit: ARC-1502PEG ja ARC-1502HEX (mõlemad lähtudes ARC-1502-st) ning ARC-1529HEX (sünteesitud ARC-1529-st, mis omakorda valmistati peptiidide tahkefaasilise sünteesi teel). NH-PEG(6)-COOH rühma lisamine ARC-1502-le vähendas veidi selle afiinsust, kuid oluliselt vähem kui 12-hüdroksüdodekaanhape ARC-1496-s. ARC-1529-le lisatud heks-5-üünhape toimis paremini kui NH-PEG(6)-COOH, kuigi afiinsuse erinevus ei olnud statistiliselt oluline. ARC-1529HEX afiinsuse täpsemaks hindamiseks tuleks kasutada tundlikumat fluorestseeruvat sondi. Sünteesitud ühendid ja saadud mõõtmistulemused pakuvad väärtuslikku teavet uute inhibiitorite disainiks.